Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms