Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q3C1V9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q3C1V9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q3C1V9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q3C1V9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q3C1V9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q3C1V9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q3C1V9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q3C1V9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q3C1V9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q3C1V9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q3C1V9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q3C1V9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Q3C1V9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q3C1V9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q3C1V9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q3C1V9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Q3C1V9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q3C1V9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3C1V9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3C1V9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3C1V9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3C1V9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3C1V9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3C1V9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3C1V9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3C1V9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3C1V9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3C1V9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3C1V9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3C1V9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3C1V9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3C1V9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3C1V9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3C1V9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3C1V9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3C1V9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3C1V9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3C1V9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3C1V9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3C1V9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3C1V9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3C1V9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3C1V9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3C1V9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3C1V9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3C1V9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3C1V9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3C1V9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3C1V9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3C1V9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3C1V9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3C1V9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3C1V9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3C1V9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3C1V9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3C1V9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3C1V9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3C1V9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3C1V9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3C1V9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3C1V9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3C1V9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3C1V9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3C1V9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3C1V9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3C1V9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3C1V9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3C1V9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3C1V9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3C1V9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3C1V9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3C1V9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3C1V9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3C1V9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3C1V9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3C1V9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3C1V9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3C1V9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3C1V9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3C1V9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3C1V9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3C1V9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q3C1V9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q3C1V9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q3C1V9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q3C1V9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q3C1V9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q3C1V9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q3C1V9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Q3C1V9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Q3C1V9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q3C1V9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q3C1V9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q3C1V9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q3C1V9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q3C1V9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q3C1V9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q3C1V9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Q3C1V9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms