Protein–RNA interactions for Protein: Q12751

RTP1, RNA polymerase II assembly factor RTP1, yeastyeast

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTP1Q12751 YGR290WYGR290W 444 nt2.5□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt2.5□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 RPL40AYIL148W 387 nt2.5□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.5□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 YPL080CYPL080C 327 nt2.5□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 JID1YPR061C 906 nt2.5□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 SNX41YDR425W 1878 nt2.5□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 SVL3YPL032C 2478 nt2.49□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 YCR064CYCR064C 411 nt2.49□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 IRC4YDR540C 540 nt2.49□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.49□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 TPM2YIL138C 486 nt2.49□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 LSM7YNL147W 348 nt2.49□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 TOF1YNL273W 3717 nt2.49□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 BNI1YNL271C 5862 nt2.49□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 SCD5YOR329C 2619 nt2.49□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 YPR097WYPR097W 3222 nt2.49□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.48□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 MTC7YEL033W 420 nt2.48□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 YLR252WYLR252W 306 nt2.48□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt2.48□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 YOR105WYOR105W 327 nt2.48□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 GAL7YBR018C 1101 nt2.48□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 STH1YIL126W 4080 nt2.47□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 USO1YDL058W 5373 nt2.47□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 SAP190YKR028W 3102 nt2.47□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 YER175W-AYER175W-A 165 nt2.47□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 EAF6YJR082C 342 nt2.47□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt2.47□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt2.47□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 MET32YDR253C 576 nt2.46□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 SNC1YAL030W 354 nt2.46□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 YKR051WYKR051W 1257 nt2.46□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 NAN1YPL126W 2691 nt2.46□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 VPH1YOR270C 2523 nt2.46□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 SHE9YDR393W 1371 nt2.46□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 NIC96YFR002W 2520 nt2.45□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 CDC50YCR094W 1176 nt2.45□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 HNT1YDL125C 477 nt2.45□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 PEX4YGR133W 552 nt2.45□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 NOP10YHR072W-A 177 nt2.45□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 BER1YLR412W 825 nt2.45□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 URA10YMR271C 684 nt2.45□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 TOA1YOR194C 861 nt2.45□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 DAD3YBR233W-A 285 nt2.45□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 SPR3YGR059W 1539 nt2.45□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 MPH1YIR002C 2982 nt2.45□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 TRL1YJL087C 2484 nt2.44□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 BRP1YGL007W 378 nt2.44□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 SPO13YHR014W 876 nt2.44□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt2.44□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 AFB1YLR040C 675 nt2.44□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 PEX17YNL214W 600 nt2.44□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 PHO80YOL001W 882 nt2.44□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 YJL181WYJL181W 1836 nt2.44□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 SNU56YDR240C 1479 nt2.44□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 YPK1YKL126W 2043 nt2.44□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 DNF1YER166W 4716 nt2.43□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 TIM10YHR005C-A 282 nt2.43□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 YLR031WYLR031W 561 nt2.43□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 RPL37AYLR185W 267 nt2.43□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 RPS7BYNL096C 573 nt2.43□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 ATP15YPL271W 189 nt2.43□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 MET18YIL128W 3099 nt2.43□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 BFA1YJR053W 1725 nt2.42□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 YDR220CYDR220C 294 nt2.42□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 EMP24YGL200C 612 nt2.42□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 RNR4YGR180C 1038 nt2.42□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 MSL1YIR009W 336 nt2.42□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 CMS1YLR003C 876 nt2.42□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 YOR333CYOR333C 417 nt2.42□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 MDM32YOR147W 1869 nt2.41□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 IST2YBR086C 2841 nt2.41□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 RPS22BYLR367W 393 nt2.41□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 RPB11YOL005C 363 nt2.41□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 PET123YOR158W 957 nt2.41□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 PHR1YOR386W 1698 nt2.41□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 CDC53YDL132W 2448 nt2.4□□□□□ -2.02
RTP1Q12751 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.4□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 MZM1YDR493W 372 nt2.4□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 GCN4YEL009C 846 nt2.4□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 TIM8YJR135W-A 264 nt2.4□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 YNL122CYNL122C 348 nt2.4□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 RPB5YBR154C 648 nt2.4□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 RUD3YOR216C 1455 nt2.39□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt2.39□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 SVS1YPL163C 783 nt2.39□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 VMA9YCL005W-A 222 nt2.39□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 SPE1YKL184W 1401 nt2.39□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 MNE1YOR350C 1992 nt2.39□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 RTT101YJL047C 2529 nt2.39□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 IPT1YDR072C 1584 nt2.39□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 VPS8YAL002W 3825 nt2.39□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 PEX8YGR077C 1770 nt2.38□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 UTP22YGR090W 3714 nt2.38□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 RVS161YCR009C 798 nt2.38□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 BNA7YDR428C 786 nt2.38□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 SMD1YGR074W 441 nt2.38□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 FYV7YLR068W 456 nt2.38□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 UTP13YLR222C 2454 nt2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 36.9 ms