Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 YDL032WYDL032W 312 nt2.42□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 YDL068WYDL068W 330 nt2.42□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.42□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 RPC10YHR143W-A 213 nt2.42□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 AIM29YKR074W 468 nt2.42□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 LCL2YLR104W 396 nt2.42□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 YLR379WYLR379W 375 nt2.42□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 YML108WYML108W 318 nt2.42□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 TOM22YNL131W 459 nt2.42□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 ACM1YPL267W 630 nt2.42□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 PRK1YIL095W 2433 nt2.42□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 NUP82YJL061W 2142 nt2.42□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 YJL181WYJL181W 1836 nt2.42□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 SLN1YIL147C 3663 nt2.41□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 PDR3YBL005W 2931 nt2.41□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 ECL1YGR146C 636 nt2.41□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.41□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 BET3YKR068C 582 nt2.41□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 SEN15YMR059W 387 nt2.41□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 LSM7YNL147W 348 nt2.41□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 YOR050CYOR050C 348 nt2.41□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 snR41snR41 95 nt2.41□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 KRE33YNL132W 3171 nt2.41□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 TAE2YPL009C 3117 nt2.41□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 RRP6YOR001W 2202 nt2.41□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 MUD2YKL074C 1584 nt2.4□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 ARP8YOR141C 2646 nt2.4□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 MZM1YDR493W 372 nt2.4□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 IRC19YLL033W 693 nt2.4□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 YNL010WYNL010W 726 nt2.4□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 YPL205CYPL205C 345 nt2.4□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 SLM6YBR266C 453 nt2.4□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 YKR078WYKR078W 1758 nt2.4□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 MSL5YLR116W 1431 nt2.4□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 YJL016WYJL016W 1686 nt2.4□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 snR70snR70 164 nt2.39□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 YHR125WYHR125W 306 nt2.39□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 NCE101YJL205C 162 nt2.39□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 YJR157WYJR157W 363 nt2.39□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 YLR269CYLR269C 351 nt2.39□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 KTI11YBL071W-A 249 nt2.39□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 MPH1YIR002C 2982 nt2.39□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 NUP100YKL068W 2880 nt2.39□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.39□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 TRS130YMR218C 3309 nt2.39□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 RNH70YGR276C 1662 nt2.38□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 NEW1YPL226W 3591 nt2.38□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.38□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 VAR1Q0140 1197 nt2.38□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 EMC6YLL014W 327 nt2.38□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt2.38□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt2.38□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 COX7YMR256C 183 nt2.38□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 YOR055WYOR055W 435 nt2.38□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 YOR248WYOR248W 303 nt2.38□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 OSW7YFR039C 1533 nt2.37□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 PPN1YDR452W 2025 nt2.37□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 SGM1YJR134C 2124 nt2.37□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 PAU8YAL068C 363 nt2.37□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 PAU20YOL161C 363 nt2.37□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 UBR1YGR184C 5853 nt2.36□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 AYR1YIL124W 894 nt2.36□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 RUF22RUF22 515 nt2.36□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 ATP3YBR039W 936 nt2.36□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 snR54snR54 86 nt2.36□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 BUB1YGR188C 3066 nt2.36□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 RAV1YJR033C 4074 nt2.36□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 SIR3YLR442C 2937 nt2.36□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 IPT1YDR072C 1584 nt2.36□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 HMLALPHA2YCL067C 633 nt2.35□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 MATALPHA2YCR039C 633 nt2.35□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 HYP2YEL034W 474 nt2.35□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 VOA1YGR106C 798 nt2.35□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 PET191YJR034W 327 nt2.35□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 TSC3YBR058C-A 243 nt2.35□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 ROX1YPR065W 1107 nt2.35□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 RPB5YBR154C 648 nt2.35□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 snR43snR43 209 nt2.35□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 NAN1YPL126W 2691 nt2.35□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 VPS52YDR484W 1926 nt2.34□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 BFA1YJR053W 1725 nt2.34□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 MLH1YMR167W 2310 nt2.34□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 CDC50YCR094W 1176 nt2.34□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 TIM9YEL020W-A 264 nt2.34□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 NOP10YHR072W-A 177 nt2.34□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 NBL1YHR199C-A 222 nt2.34□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt2.34□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 YAR068WYAR068W 486 nt2.34□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 GRX8YLR364W 330 nt2.34□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 SAS2YMR127C 1017 nt2.34□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt2.34□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.34□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 YPR039WYPR039W 336 nt2.34□□□□□ -2.03
NMD4Q12129 GIP3YPL137C 3831 nt2.34□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 SOK2YMR016C 2358 nt2.34□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 UBP15YMR304W 3693 nt2.33□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 IRC10YOL015W 1761 nt2.33□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 PDR11YIL013C 4236 nt2.33□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.33□□□□□ -2.04
NMD4Q12129 GET1YGL020C 708 nt2.33□□□□□ -2.04
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