Protein–RNA interactions for Protein: Q02100

SKO1, CRE-binding bZIP protein SKO1, yeastyeast

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Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKO1Q02100 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.18□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 LCL2YLR104W 396 nt2.18□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 PKR1YMR123W 369 nt2.18□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 DGK1YOR311C 873 nt2.18□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 NUP82YJL061W 2142 nt2.18□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 IPT1YDR072C 1584 nt2.18□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt2.17□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 BFA1YJR053W 1725 nt2.17□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 RPO41YFL036W 4056 nt2.17□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 ARP8YOR141C 2646 nt2.17□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 YDL068WYDL068W 330 nt2.17□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 NOP10YHR072W-A 177 nt2.17□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 SNC1YAL030W 354 nt2.17□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 YJR079WYJR079W 330 nt2.17□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 UBP15YMR304W 3693 nt2.17□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 MZM1YDR493W 372 nt2.16□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 YGR045CYGR045C 363 nt2.16□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 RPL16AYIL133C 600 nt2.16□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 NCE101YJL205C 162 nt2.16□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 YKL111CYKL111C 336 nt2.16□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 EMC6YLL014W 327 nt2.16□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.16□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 CTK3YML112W 891 nt2.16□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 SAS2YMR127C 1017 nt2.16□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 PBI2YNL015W 228 nt2.16□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 YOR050CYOR050C 348 nt2.16□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 YOR055WYOR055W 435 nt2.16□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 YPL068CYPL068C 882 nt2.16□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 CLN3YAL040C 1743 nt2.16□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 PTP3YER075C 2787 nt2.15□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 SEC26YDR238C 2922 nt2.15□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 CDC50YCR094W 1176 nt2.15□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 RPC10YHR143W-A 213 nt2.15□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 YLR202CYLR202C 327 nt2.15□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 YNL010WYNL010W 726 nt2.15□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 NOP15YNL110C 663 nt2.15□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 ROX1YPR065W 1107 nt2.15□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 UBR2YLR024C 5619 nt2.14□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 SMD1YGR074W 441 nt2.14□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.14□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 IRC19YLL033W 693 nt2.14□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 FYV7YLR068W 456 nt2.14□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 RMP1YLR145W 606 nt2.14□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 GRX8YLR364W 330 nt2.14□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 SEN15YMR059W 387 nt2.14□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 DDR48YMR173W 1293 nt2.14□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 YBL108WYBL108W 306 nt2.14□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 GAL7YBR018C 1101 nt2.14□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 YPR097WYPR097W 3222 nt2.14□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 VPS41YDR080W 2979 nt2.14□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 ESL2YKR096W 3588 nt2.14□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 MGM1YOR211C 2646 nt2.13□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 VOA1YGR106C 798 nt2.13□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 MSL1YIR009W 336 nt2.13□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.13□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 TMA10YLR327C 261 nt2.13□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 ATP19YOL077W-A 207 nt2.13□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 TOR2YKL203C 7425 nt2.13□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 BNI1YNL271C 5862 nt2.13□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 AFI1YOR129C 2682 nt2.13□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 YJL016WYJL016W 1686 nt2.12□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 USO1YDL058W 5373 nt2.12□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 SNX41YDR425W 1878 nt2.12□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 CSF1YLR087C 8877 nt2.12□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 YLR456WYLR456W 615 nt2.12□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 RPB5YBR154C 648 nt2.12□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 PDR1YGL013C 3207 nt2.12□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 SGS1YMR190C 4344 nt2.12□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 CDC53YDL132W 2448 nt2.11□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 MMS22YLR320W 4365 nt2.11□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 TOF1YNL273W 3717 nt2.11□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 GIN4YDR507C 3429 nt2.11□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt2.11□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 BIG1YHR101C 1008 nt2.11□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.11□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 AYR1YIL124W 894 nt2.11□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 SIP18YMR175W 240 nt2.11□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 YMR324CYMR324C 243 nt2.11□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 PET123YOR158W 957 nt2.11□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 SLM6YBR266C 453 nt2.11□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt2.11□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt2.11□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt2.11□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 MET18YIL128W 3099 nt2.11□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 TUS1YLR425W 3924 nt2.1□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 NIC96YFR002W 2520 nt2.1□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 MXR1YER042W 555 nt2.1□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 YER084W-AYER084W-A 513 nt2.1□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 COX13YGL191W 390 nt2.1□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 YHR130CYHR130C 336 nt2.1□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt2.1□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 COX7YMR256C 183 nt2.1□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 YOR333CYOR333C 417 nt2.1□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 RTC6YPL183W-A 282 nt2.1□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 STE11YLR362W 2154 nt2.1□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 PDR11YIL013C 4236 nt2.1□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 VPS52YDR484W 1926 nt2.09□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 SPO22YIL073C 2928 nt2.09□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.09□□□□□ -2.07
SKO1Q02100 IRC10YOL015W 1761 nt2.08□□□□□ -2.08
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