Protein–RNA interactions for Protein: P46970

NMD5, Nonsense-mediated mRNA decay protein 5, yeastyeast

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD5P46970 YKL111CYKL111C 336 nt2.8□□□□□ -1.96
NMD5P46970 YMR320WYMR320W 306 nt2.8□□□□□ -1.96
NMD5P46970 RPB11YOL005C 363 nt2.8□□□□□ -1.96
NMD5P46970 EGD1YPL037C 474 nt2.8□□□□□ -1.96
NMD5P46970 SNF12YNR023W 1701 nt2.79□□□□□ -1.96
NMD5P46970 NET1YJL076W 3570 nt2.79□□□□□ -1.96
NMD5P46970 GCN4YEL009C 846 nt2.79□□□□□ -1.96
NMD5P46970 YJL202CYJL202C 348 nt2.79□□□□□ -1.96
NMD5P46970 RPL20AYMR242C 519 nt2.79□□□□□ -1.96
NMD5P46970 CYR1YJL005W 6081 nt2.79□□□□□ -1.96
NMD5P46970 NAB3YPL190C 2409 nt2.79□□□□□ -1.96
NMD5P46970 YSW1YBR148W 1830 nt2.78□□□□□ -1.96
NMD5P46970 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.78□□□□□ -1.96
NMD5P46970 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.78□□□□□ -1.96
NMD5P46970 PEX4YGR133W 552 nt2.78□□□□□ -1.96
NMD5P46970 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.78□□□□□ -1.96
NMD5P46970 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.78□□□□□ -1.96
NMD5P46970 APC9YLR102C 798 nt2.78□□□□□ -1.96
NMD5P46970 SOK1YDR006C 2706 nt2.77□□□□□ -1.97
NMD5P46970 YPL150WYPL150W 2706 nt2.77□□□□□ -1.97
NMD5P46970 MDM32YOR147W 1869 nt2.77□□□□□ -1.97
NMD5P46970 SRO77YBL106C 3033 nt2.77□□□□□ -1.97
NMD5P46970 FRE2YKL220C 2136 nt2.77□□□□□ -1.97
NMD5P46970 STE5YDR103W 2754 nt2.77□□□□□ -1.97
NMD5P46970 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt2.77□□□□□ -1.97
NMD5P46970 BAT1YHR208W 1182 nt2.77□□□□□ -1.97
NMD5P46970 MSL1YIR009W 336 nt2.77□□□□□ -1.97
NMD5P46970 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt2.77□□□□□ -1.97
NMD5P46970 YPL238CYPL238C 390 nt2.77□□□□□ -1.97
NMD5P46970 FLO11YIR019C 4104 nt2.77□□□□□ -1.97
NMD5P46970 ESL2YKR096W 3588 nt2.76□□□□□ -1.97
NMD5P46970 NDD1YOR372C 1665 nt2.76□□□□□ -1.97
NMD5P46970 RSN1YMR266W 2862 nt2.76□□□□□ -1.97
NMD5P46970 Q0032Q0032 291 nt2.76□□□□□ -1.97
NMD5P46970 TIF35YDR429C 825 nt2.76□□□□□ -1.97
NMD5P46970 RPL8BYLL045C 771 nt2.76□□□□□ -1.97
NMD5P46970 YPR014CYPR014C 330 nt2.76□□□□□ -1.97
NMD5P46970 PSY2YNL201C 2577 nt2.76□□□□□ -1.97
NMD5P46970 TRZ1YKR079C 2517 nt2.76□□□□□ -1.97
NMD5P46970 SRB8YCR081W 4284 nt2.76□□□□□ -1.97
NMD5P46970 RGR1YLR071C 3249 nt2.76□□□□□ -1.97
NMD5P46970 RTT10YPL183C 3042 nt2.75□□□□□ -1.97
NMD5P46970 BOI1YBL085W 2943 nt2.75□□□□□ -1.97
NMD5P46970 IKI3YLR384C 4050 nt2.75□□□□□ -1.97
NMD5P46970 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.75□□□□□ -1.97
NMD5P46970 YLR031WYLR031W 561 nt2.75□□□□□ -1.97
NMD5P46970 YOR225WYOR225W 330 nt2.75□□□□□ -1.97
NMD5P46970 PRP8YHR165C 7242 nt2.74□□□□□ -1.97
NMD5P46970 SAP1YER047C 2694 nt2.74□□□□□ -1.97
NMD5P46970 CAJ1YER048C 1176 nt2.74□□□□□ -1.97
NMD5P46970 URM1YIL008W 300 nt2.74□□□□□ -1.97
NMD5P46970 RPL39YJL189W 156 nt2.74□□□□□ -1.97
NMD5P46970 TIM8YJR135W-A 264 nt2.74□□□□□ -1.97
NMD5P46970 SHE2YKL130C 741 nt2.74□□□□□ -1.97
NMD5P46970 KEL2YGR238C 2649 nt2.74□□□□□ -1.97
NMD5P46970 AI2Q0055 2565 nt2.74□□□□□ -1.97
NMD5P46970 BIT61YJL058C 1632 nt2.73□□□□□ -1.97
NMD5P46970 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt2.73□□□□□ -1.97
NMD5P46970 ISU1YPL135W 498 nt2.73□□□□□ -1.97
NMD5P46970 CWC22YGR278W 1734 nt2.73□□□□□ -1.97
NMD5P46970 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
NMD5P46970 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
NMD5P46970 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
NMD5P46970 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
NMD5P46970 YER138CYER138C 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
NMD5P46970 YER160CYER160C 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
NMD5P46970 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
NMD5P46970 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
NMD5P46970 YJR027WYJR027W 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
NMD5P46970 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
NMD5P46970 YML039WYML039W 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
NMD5P46970 YML045WYML045W 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
NMD5P46970 YMR050CYMR050C 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
NMD5P46970 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
NMD5P46970 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.73□□□□□ -1.97
NMD5P46970 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
NMD5P46970 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
NMD5P46970 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.73□□□□□ -1.97
NMD5P46970 TFB1YDR311W 1929 nt2.72□□□□□ -1.97
NMD5P46970 SPG3YDR504C 384 nt2.72□□□□□ -1.97
NMD5P46970 PAU14YIL176C 363 nt2.72□□□□□ -1.97
NMD5P46970 PAU1YJL223C 363 nt2.72□□□□□ -1.97
NMD5P46970 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt2.72□□□□□ -1.97
NMD5P46970 RPS22BYLR367W 393 nt2.72□□□□□ -1.97
NMD5P46970 PRE8YML092C 753 nt2.72□□□□□ -1.97
NMD5P46970 PGA1YNL158W 597 nt2.72□□□□□ -1.97
NMD5P46970 IRC23YOR044W 474 nt2.72□□□□□ -1.97
NMD5P46970 NMA111YNL123W 2994 nt2.72□□□□□ -1.97
NMD5P46970 YOL057WYOL057W 2136 nt2.71□□□□□ -1.98
NMD5P46970 TSA2YDR453C 591 nt2.71□□□□□ -1.98
NMD5P46970 HPA3YEL066W 540 nt2.71□□□□□ -1.98
NMD5P46970 ISF1YMR081C 1017 nt2.71□□□□□ -1.98
NMD5P46970 COX7YMR256C 183 nt2.71□□□□□ -1.98
NMD5P46970 MET6YER091C 2304 nt2.7□□□□□ -1.98
NMD5P46970 YFR056CYFR056C 369 nt2.7□□□□□ -1.98
NMD5P46970 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.7□□□□□ -1.98
NMD5P46970 COX14YML129C 213 nt2.7□□□□□ -1.98
NMD5P46970 YPR203WYPR203W 309 nt2.7□□□□□ -1.98
NMD5P46970 COX1Q0045 1605 nt2.7□□□□□ -1.98
NMD5P46970 ORC1YML065W 2745 nt2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 133.2 ms