Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNE2O96020 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE2O96020 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms