Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FZD4Q9ULV1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FZD4Q9ULV1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FZD4Q9ULV1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FZD4Q9ULV1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FZD4Q9ULV1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FZD4Q9ULV1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FZD4Q9ULV1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FZD4Q9ULV1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FZD4Q9ULV1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FZD4Q9ULV1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FZD4Q9ULV1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FZD4Q9ULV1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FZD4Q9ULV1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FZD4Q9ULV1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FZD4Q9ULV1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FZD4Q9ULV1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FZD4Q9ULV1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FZD4Q9ULV1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FZD4Q9ULV1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FZD4Q9ULV1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FZD4Q9ULV1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FZD4Q9ULV1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FZD4Q9ULV1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FZD4Q9ULV1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FZD4Q9ULV1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FZD4Q9ULV1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FZD4Q9ULV1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FZD4Q9ULV1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FZD4Q9ULV1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FZD4Q9ULV1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FZD4Q9ULV1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
FZD4Q9ULV1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
FZD4Q9ULV1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
FZD4Q9ULV1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FZD4Q9ULV1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FZD4Q9ULV1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FZD4Q9ULV1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FZD4Q9ULV1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FZD4Q9ULV1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FZD4Q9ULV1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FZD4Q9ULV1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FZD4Q9ULV1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FZD4Q9ULV1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FZD4Q9ULV1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FZD4Q9ULV1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FZD4Q9ULV1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FZD4Q9ULV1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FZD4Q9ULV1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FZD4Q9ULV1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FZD4Q9ULV1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FZD4Q9ULV1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FZD4Q9ULV1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FZD4Q9ULV1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FZD4Q9ULV1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FZD4Q9ULV1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FZD4Q9ULV1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FZD4Q9ULV1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FZD4Q9ULV1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
FZD4Q9ULV1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FZD4Q9ULV1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FZD4Q9ULV1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FZD4Q9ULV1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
FZD4Q9ULV1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FZD4Q9ULV1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FZD4Q9ULV1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FZD4Q9ULV1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FZD4Q9ULV1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FZD4Q9ULV1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FZD4Q9ULV1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
FZD4Q9ULV1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FZD4Q9ULV1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FZD4Q9ULV1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FZD4Q9ULV1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
FZD4Q9ULV1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FZD4Q9ULV1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FZD4Q9ULV1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FZD4Q9ULV1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FZD4Q9ULV1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FZD4Q9ULV1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FZD4Q9ULV1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FZD4Q9ULV1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FZD4Q9ULV1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FZD4Q9ULV1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FZD4Q9ULV1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FZD4Q9ULV1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FZD4Q9ULV1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FZD4Q9ULV1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FZD4Q9ULV1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FZD4Q9ULV1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FZD4Q9ULV1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FZD4Q9ULV1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FZD4Q9ULV1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FZD4Q9ULV1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FZD4Q9ULV1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FZD4Q9ULV1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FZD4Q9ULV1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FZD4Q9ULV1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FZD4Q9ULV1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FZD4Q9ULV1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms