Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
NRXN1Q9ULB1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
NRXN1Q9ULB1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
NRXN1Q9ULB1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
NRXN1Q9ULB1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
NRXN1Q9ULB1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
NRXN1Q9ULB1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
NRXN1Q9ULB1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
NRXN1Q9ULB1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
NRXN1Q9ULB1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
NRXN1Q9ULB1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
NRXN1Q9ULB1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
NRXN1Q9ULB1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
NRXN1Q9ULB1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NRXN1Q9ULB1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC37.76■■■■□ 3.63
NRXN1Q9ULB1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
NRXN1Q9ULB1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
NRXN1Q9ULB1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NRXN1Q9ULB1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
NRXN1Q9ULB1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
NRXN1Q9ULB1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NRXN1Q9ULB1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NRXN1Q9ULB1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
NRXN1Q9ULB1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
NRXN1Q9ULB1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
NRXN1Q9ULB1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC37.71■■■■□ 3.63
NRXN1Q9ULB1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
NRXN1Q9ULB1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
NRXN1Q9ULB1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
NRXN1Q9ULB1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
NRXN1Q9ULB1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
NRXN1Q9ULB1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
NRXN1Q9ULB1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NRXN1Q9ULB1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
NRXN1Q9ULB1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
NRXN1Q9ULB1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
NRXN1Q9ULB1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
NRXN1Q9ULB1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
NRXN1Q9ULB1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
NRXN1Q9ULB1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
NRXN1Q9ULB1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
NRXN1Q9ULB1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NRXN1Q9ULB1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
NRXN1Q9ULB1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
NRXN1Q9ULB1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
NRXN1Q9ULB1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
NRXN1Q9ULB1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
NRXN1Q9ULB1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
NRXN1Q9ULB1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC37.57■■■■□ 3.6
NRXN1Q9ULB1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
NRXN1Q9ULB1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
NRXN1Q9ULB1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
NRXN1Q9ULB1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
NRXN1Q9ULB1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
NRXN1Q9ULB1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
NRXN1Q9ULB1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
NRXN1Q9ULB1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
NRXN1Q9ULB1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
NRXN1Q9ULB1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
NRXN1Q9ULB1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
NRXN1Q9ULB1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
NRXN1Q9ULB1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.54■■■■□ 3.6
NRXN1Q9ULB1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
NRXN1Q9ULB1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NRXN1Q9ULB1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
NRXN1Q9ULB1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
NRXN1Q9ULB1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
NRXN1Q9ULB1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NRXN1Q9ULB1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NRXN1Q9ULB1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
NRXN1Q9ULB1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
NRXN1Q9ULB1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
NRXN1Q9ULB1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NRXN1Q9ULB1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NRXN1Q9ULB1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NRXN1Q9ULB1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
NRXN1Q9ULB1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
NRXN1Q9ULB1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NRXN1Q9ULB1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NRXN1Q9ULB1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NRXN1Q9ULB1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NRXN1Q9ULB1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
NRXN1Q9ULB1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
NRXN1Q9ULB1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
NRXN1Q9ULB1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
NRXN1Q9ULB1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
NRXN1Q9ULB1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
NRXN1Q9ULB1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
NRXN1Q9ULB1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
NRXN1Q9ULB1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
NRXN1Q9ULB1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NRXN1Q9ULB1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
NRXN1Q9ULB1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
NRXN1Q9ULB1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
NRXN1Q9ULB1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
NRXN1Q9ULB1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
NRXN1Q9ULB1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
NRXN1Q9ULB1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
NRXN1Q9ULB1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
NRXN1Q9ULB1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms