Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB9

PGLYRP3, Peptidoglycan recognition protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP3Q96LB9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGLYRP3Q96LB9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGLYRP3Q96LB9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGLYRP3Q96LB9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGLYRP3Q96LB9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGLYRP3Q96LB9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGLYRP3Q96LB9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGLYRP3Q96LB9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGLYRP3Q96LB9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGLYRP3Q96LB9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PGLYRP3Q96LB9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGLYRP3Q96LB9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGLYRP3Q96LB9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGLYRP3Q96LB9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGLYRP3Q96LB9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGLYRP3Q96LB9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGLYRP3Q96LB9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGLYRP3Q96LB9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGLYRP3Q96LB9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGLYRP3Q96LB9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGLYRP3Q96LB9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PGLYRP3Q96LB9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGLYRP3Q96LB9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGLYRP3Q96LB9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGLYRP3Q96LB9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PGLYRP3Q96LB9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGLYRP3Q96LB9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGLYRP3Q96LB9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGLYRP3Q96LB9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGLYRP3Q96LB9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGLYRP3Q96LB9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGLYRP3Q96LB9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGLYRP3Q96LB9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGLYRP3Q96LB9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGLYRP3Q96LB9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGLYRP3Q96LB9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGLYRP3Q96LB9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGLYRP3Q96LB9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGLYRP3Q96LB9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGLYRP3Q96LB9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGLYRP3Q96LB9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGLYRP3Q96LB9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGLYRP3Q96LB9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGLYRP3Q96LB9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGLYRP3Q96LB9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PGLYRP3Q96LB9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGLYRP3Q96LB9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGLYRP3Q96LB9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGLYRP3Q96LB9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGLYRP3Q96LB9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGLYRP3Q96LB9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGLYRP3Q96LB9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGLYRP3Q96LB9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGLYRP3Q96LB9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGLYRP3Q96LB9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGLYRP3Q96LB9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PGLYRP3Q96LB9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGLYRP3Q96LB9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGLYRP3Q96LB9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGLYRP3Q96LB9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGLYRP3Q96LB9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGLYRP3Q96LB9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGLYRP3Q96LB9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PGLYRP3Q96LB9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PGLYRP3Q96LB9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGLYRP3Q96LB9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGLYRP3Q96LB9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGLYRP3Q96LB9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGLYRP3Q96LB9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGLYRP3Q96LB9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGLYRP3Q96LB9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGLYRP3Q96LB9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGLYRP3Q96LB9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGLYRP3Q96LB9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGLYRP3Q96LB9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGLYRP3Q96LB9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGLYRP3Q96LB9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGLYRP3Q96LB9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGLYRP3Q96LB9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGLYRP3Q96LB9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGLYRP3Q96LB9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGLYRP3Q96LB9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGLYRP3Q96LB9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGLYRP3Q96LB9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGLYRP3Q96LB9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGLYRP3Q96LB9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGLYRP3Q96LB9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGLYRP3Q96LB9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGLYRP3Q96LB9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGLYRP3Q96LB9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGLYRP3Q96LB9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PGLYRP3Q96LB9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGLYRP3Q96LB9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGLYRP3Q96LB9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGLYRP3Q96LB9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGLYRP3Q96LB9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGLYRP3Q96LB9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGLYRP3Q96LB9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGLYRP3Q96LB9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGLYRP3Q96LB9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms