Protein–RNA interactions for Protein: Q96J01

THOC3, THO complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOC3Q96J01 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THOC3Q96J01 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THOC3Q96J01 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THOC3Q96J01 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
THOC3Q96J01 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
THOC3Q96J01 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
THOC3Q96J01 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
THOC3Q96J01 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
THOC3Q96J01 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
THOC3Q96J01 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THOC3Q96J01 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THOC3Q96J01 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THOC3Q96J01 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
THOC3Q96J01 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
THOC3Q96J01 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
THOC3Q96J01 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THOC3Q96J01 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THOC3Q96J01 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THOC3Q96J01 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
THOC3Q96J01 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
THOC3Q96J01 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
THOC3Q96J01 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
THOC3Q96J01 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
THOC3Q96J01 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
THOC3Q96J01 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
THOC3Q96J01 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
THOC3Q96J01 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THOC3Q96J01 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THOC3Q96J01 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THOC3Q96J01 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
THOC3Q96J01 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THOC3Q96J01 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THOC3Q96J01 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THOC3Q96J01 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THOC3Q96J01 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THOC3Q96J01 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
THOC3Q96J01 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
THOC3Q96J01 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
THOC3Q96J01 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
THOC3Q96J01 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
THOC3Q96J01 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THOC3Q96J01 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THOC3Q96J01 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THOC3Q96J01 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THOC3Q96J01 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THOC3Q96J01 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THOC3Q96J01 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THOC3Q96J01 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
THOC3Q96J01 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
THOC3Q96J01 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THOC3Q96J01 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THOC3Q96J01 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
THOC3Q96J01 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
THOC3Q96J01 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
THOC3Q96J01 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
THOC3Q96J01 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THOC3Q96J01 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THOC3Q96J01 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THOC3Q96J01 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THOC3Q96J01 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THOC3Q96J01 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THOC3Q96J01 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THOC3Q96J01 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THOC3Q96J01 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
THOC3Q96J01 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
THOC3Q96J01 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
THOC3Q96J01 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
THOC3Q96J01 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
THOC3Q96J01 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
THOC3Q96J01 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
THOC3Q96J01 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
THOC3Q96J01 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
THOC3Q96J01 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THOC3Q96J01 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THOC3Q96J01 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THOC3Q96J01 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THOC3Q96J01 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THOC3Q96J01 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THOC3Q96J01 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THOC3Q96J01 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THOC3Q96J01 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THOC3Q96J01 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THOC3Q96J01 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THOC3Q96J01 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
THOC3Q96J01 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
THOC3Q96J01 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
THOC3Q96J01 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
THOC3Q96J01 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THOC3Q96J01 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
THOC3Q96J01 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THOC3Q96J01 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THOC3Q96J01 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THOC3Q96J01 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THOC3Q96J01 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
THOC3Q96J01 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
THOC3Q96J01 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
THOC3Q96J01 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
THOC3Q96J01 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
THOC3Q96J01 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THOC3Q96J01 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms