Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC51

SERBP1, Plasminogen activator inhibitor 1 RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERBP1Q8NC51 LMNB1-203ENST00000460265 3475 ntTSL 1 (best)15.69■□□□□ 0.15e-8■■■■■ 60.8
SERBP1Q8NC51 GNB2-210ENST00000451587 887 ntTSL 514.08□□□□□ -0.163e-8■■■■■ 60.8
SERBP1Q8NC51 LMNB1-205ENST00000472034 730 ntTSL 35.7□□□□□ -1.55e-8■■■■■ 60.8
SERBP1Q8NC51 LMNB1-208ENST00000504788 1801 ntTSL 24.88□□□□□ -1.635e-8■■■■■ 60.8
SERBP1Q8NC51 GATA2-205ENST00000492608 844 ntTSL 318.2■□□□□ 0.54e-6■■■■■ 60.4
SERBP1Q8NC51 GATA2-206ENST00000498200 563 ntTSL 217.41■□□□□ 0.384e-6■■■■■ 60.4
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SERBP1Q8NC51 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.264e-6■■■■■ 60.2
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SERBP1Q8NC51 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.138e-8■■■■■ 59.8
SERBP1Q8NC51 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.175e-7■■■■■ 59
SERBP1Q8NC51 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.755e-8■■■■■ 58.8
SERBP1Q8NC51 RNPEPL1-208ENST00000486058 3126 ntTSL 215.43■□□□□ 0.065e-8■■■■■ 58.8
SERBP1Q8NC51 RNPEPL1-203ENST00000451363 538 ntTSL 414.44□□□□□ -0.15e-8■■■■■ 58.8
SERBP1Q8NC51 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.293e-6■■■■■ 58.2
SERBP1Q8NC51 HFM1-202ENST00000427444 672 ntTSL 511.87□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 57.7
SERBP1Q8NC51 HFM1-204ENST00000448819 540 ntTSL 510.07□□□□□ -0.82e-6■■■■■ 57.7
SERBP1Q8NC51 HFM1-208ENST00000488023 1699 ntTSL 55.89□□□□□ -1.472e-6■■■■■ 57.7
SERBP1Q8NC51 HFM1-207ENST00000481900 2020 ntTSL 55.31□□□□□ -1.562e-6■■■■■ 57.7
SERBP1Q8NC51 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.072e-6■■■■■ 57.7
SERBP1Q8NC51 KHSRP-210ENST00000599395 837 ntTSL 513.14□□□□□ -0.311e-13■■■■■ 57.4
SERBP1Q8NC51 CKB-205ENST00000553878 856 ntTSL 228.58■■■□□ 2.173e-6■■■■■ 57.2
SERBP1Q8NC51 CKB-206ENST00000553994 746 ntTSL 228.58■■■□□ 2.173e-6■■■■■ 57.2
SERBP1Q8NC51 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.094e-7■■■■■ 57.2
SERBP1Q8NC51 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.584e-10■■■■■ 57.2
SERBP1Q8NC51 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.494e-10■■■■■ 57.2
SERBP1Q8NC51 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.434e-10■■■■■ 57.2
SERBP1Q8NC51 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.214e-7■■■■■ 57.2
SERBP1Q8NC51 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.174e-7■■■■■ 57.2
SERBP1Q8NC51 YDJC-205ENST00000468686 1423 ntTSL 1 (best)20.7■□□□□ 0.94e-7■■■■■ 57.2
SERBP1Q8NC51 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.884e-7■■■■■ 57.2
SERBP1Q8NC51 OTUD5-205ENST00000455452 2077 ntTSL 520.44■□□□□ 0.864e-10■■■■■ 57.2
SERBP1Q8NC51 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.824e-10■■■■■ 57.2
SERBP1Q8NC51 DNAAF5-203ENST00000437419 585 ntTSL 519.93■□□□□ 0.784e-7■■■■■ 57.2
SERBP1Q8NC51 DNAAF5-204ENST00000438961 579 ntTSL 419.84■□□□□ 0.774e-7■■■■■ 57.2
SERBP1Q8NC51 MVD-209ENST00000565149 2352 ntTSL 1 (best)19.55■□□□□ 0.724e-7■■■■■ 57.2
SERBP1Q8NC51 YDJC-207ENST00000482998 1388 ntTSL 519.42■□□□□ 0.74e-7■■■■■ 57.2
SERBP1Q8NC51 YDJC-204ENST00000464015 1613 ntTSL 1 (best)19.11■□□□□ 0.654e-7■■■■■ 57.2
SERBP1Q8NC51 YDJC-206ENST00000473985 1494 ntTSL 518.74■□□□□ 0.594e-7■■■■■ 57.2
SERBP1Q8NC51 DNAAF5-205ENST00000440747 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 218.7■□□□□ 0.584e-7■■■■■ 57.2
SERBP1Q8NC51 RHOA-204ENST00000431929 539 ntTSL 418.28■□□□□ 0.524e-10■■■■■ 57.2
SERBP1Q8NC51 RHOA-201ENST00000265538 388 ntTSL 418.12■□□□□ 0.494e-10■■■■■ 57.2
SERBP1Q8NC51 YDJC-203ENST00000415762 1410 ntTSL 1 (best)17.89■□□□□ 0.464e-7■■■■■ 57.2
SERBP1Q8NC51 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.344e-7■■■■■ 57.2
SERBP1Q8NC51 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.314e-7■■■■■ 57.2
SERBP1Q8NC51 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.274e-7■■■■■ 57.2
SERBP1Q8NC51 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.234e-7■■■■■ 57.2
SERBP1Q8NC51 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.224e-7■■■■■ 57.2
SERBP1Q8NC51 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.044e-10■■■■■ 57.2
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SERBP1Q8NC51 RHOA-205ENST00000445425 633 ntTSL 314.52□□□□□ -0.094e-10■■■■■ 57.2
SERBP1Q8NC51 KPNB1-214ENST00000583648 896 ntTSL 413.92□□□□□ -0.184e-10■■■■■ 57.2
SERBP1Q8NC51 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.194e-7■■■■■ 57.2
SERBP1Q8NC51 ANXA11-205ENST00000438331 6965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.444e-7■■■■■ 57.2
SERBP1Q8NC51 ANXA11-202ENST00000372231 6720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.454e-7■■■■■ 57.2
SERBP1Q8NC51 KPNB1-201ENST00000290158 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.734e-10■■■■■ 57.2
SERBP1Q8NC51 RHOA-203ENST00000422781 961 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.764e-10■■■■■ 57.2
SERBP1Q8NC51 KPNB1-202ENST00000535458 3163 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.964e-10■■■■■ 57.2
SERBP1Q8NC51 AC005726.2-201ENST00000481916 2091 ntTSL 1 (best)21.74■■□□□ 1.071e-7■■■■■ 56.9
SERBP1Q8NC51 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.591e-7■■■■■ 56.9
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SERBP1Q8NC51 ALDOC-203ENST00000395321 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.491e-7■■■■■ 56.9
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SERBP1Q8NC51 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.441e-6■■■■■ 55.8
SERBP1Q8NC51 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.723e-11■■■■■ 54.8
SERBP1Q8NC51 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.177e-8■■■■■ 54.8
SERBP1Q8NC51 PCSK9-201ENST00000302118 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.417e-8■■■■■ 54.8
SERBP1Q8NC51 PCSK9-202ENST00000490692 3891 ntTSL 211.77□□□□□ -0.537e-8■■■■■ 54.8
SERBP1Q8NC51 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.892e-6■■■■■ 53.2
SERBP1Q8NC51 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 53.2
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SERBP1Q8NC51 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.733e-6■■■■■ 52.4
SERBP1Q8NC51 CHCHD10-203ENST00000517886 494 ntTSL 319.62■□□□□ 0.733e-6■■■■■ 52.4
SERBP1Q8NC51 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.543e-6■■■■■ 52.4
SERBP1Q8NC51 VARS-220ENST00000461874 845 ntTSL 518.11■□□□□ 0.496e-7■■■■■ 52.4
SERBP1Q8NC51 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 52.4
SERBP1Q8NC51 VARS-216ENST00000428445 863 ntTSL 515.49■□□□□ 0.076e-7■■■■■ 52.4
SERBP1Q8NC51 CHCHD10-204ENST00000520222 384 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.33e-6■■■■■ 52.4
SERBP1Q8NC51 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.421e-10■■■■■ 51.9
SERBP1Q8NC51 PTP4A1-202ENST00000470661 479 ntTSL 210.61□□□□□ -0.711e-10■■■■■ 51.9
SERBP1Q8NC51 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.162e-6■■■■■ 51.8
SERBP1Q8NC51 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.022e-6■■■■■ 51.8
SERBP1Q8NC51 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.922e-6■■■■■ 51.8
SERBP1Q8NC51 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 51.8
SERBP1Q8NC51 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.092e-7■■■■■ 51.5
SERBP1Q8NC51 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.872e-7■■■■■ 51.5
SERBP1Q8NC51 SPN-205ENST00000563039 1853 ntTSL 519.42■□□□□ 0.72e-7■■■■■ 51.5
SERBP1Q8NC51 SPN-203ENST00000436527 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)17.27■□□□□ 0.362e-7■■■■■ 51.5
SERBP1Q8NC51 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.142e-7■■■■■ 51.5
SERBP1Q8NC51 MIB1-204ENST00000578646 3306 ntTSL 211.3□□□□□ -0.62e-7■■■■■ 51.5
SERBP1Q8NC51 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 50.8
SERBP1Q8NC51 RNF10-203ENST00000413266 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.518e-17■■■■■ 50.8
SERBP1Q8NC51 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.755e-6■■■■■ 50.8
SERBP1Q8NC51 CKB-214ENST00000555770 816 ntTSL 424.44■■□□□ 1.53e-6■■■■■ 50.5
SERBP1Q8NC51 CKB-208ENST00000554426 775 ntTSL 524.4■■□□□ 1.53e-6■■■■■ 50.5
SERBP1Q8NC51 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.333e-6■■■■■ 50.5
SERBP1Q8NC51 CKB-209ENST00000554705 803 ntTSL 218.62■□□□□ 0.573e-6■■■■■ 50.5
SERBP1Q8NC51 CKB-213ENST00000555659 755 ntTSL 217.93■□□□□ 0.463e-6■■■■■ 50.5
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