RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000406525.6

LARP4B-202, Transcript of La ribonucleoprotein domain family member 4B, humanhuman

TSL 5

Gene LARP4B, Length 681 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP4B-202ENST00000406525 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.23■■■■■ 8.19
LARP4B-202ENST00000406525 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa59.04■■■■■ 7.04
LARP4B-202ENST00000406525 ABCC9O60706 1549 aa58.13■■■■■ 6.9
LARP4B-202ENST00000406525 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.82■■■■■ 6.53
LARP4B-202ENST00000406525 NACADO15069 1562 aa55.69■■■■■ 6.51
LARP4B-202ENST00000406525 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.46■■■■■ 6.47
LARP4B-202ENST00000406525 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.3■■■■■ 6.44
LARP4B-202ENST00000406525 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.06■■■■■ 6.41
LARP4B-202ENST00000406525 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.86■■■■■ 6.37
LARP4B-202ENST00000406525 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.35■■■■■ 6.29
LARP4B-202ENST00000406525 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.27■■■■■ 6.28
LARP4B-202ENST00000406525 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.17■■■■■ 6.26
LARP4B-202ENST00000406525 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.07■■■■■ 6.25
LARP4B-202ENST00000406525 SCRIBQ14160 1630 aa53.73■■■■■ 6.19
LARP4B-202ENST00000406525 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.66■■■■■ 6.18
LARP4B-202ENST00000406525 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.7■■■■■ 6.03
LARP4B-202ENST00000406525 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.57■■■■■ 6.01
LARP4B-202ENST00000406525 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.34■■■■■ 5.97
LARP4B-202ENST00000406525 SMARCA4P51532 1647 aa51.42■■■■■ 5.82
LARP4B-202ENST00000406525 NCAPD3P42695 1498 aa51.42■■■■■ 5.82
LARP4B-202ENST00000406525 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.38■■■■■ 5.82
LARP4B-202ENST00000406525 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.32■■■■■ 5.81
LARP4B-202ENST00000406525 SMARCA2P51531 1590 aa51.26■■■■■ 5.8
LARP4B-202ENST00000406525 HMGXB3Q12766 1538 aa51.08■■■■■ 5.77
LARP4B-202ENST00000406525 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.02■■■■■ 5.76
LARP4B-202ENST00000406525 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.98■■■■■ 5.75
LARP4B-202ENST00000406525 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.86■■■■■ 5.73
LARP4B-202ENST00000406525 WIZO95785 1651 aa50.35■■■■■ 5.65
LARP4B-202ENST00000406525 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.3■■■■■ 5.64
LARP4B-202ENST00000406525 ERCC6Q03468 1493 aa50.19■■■■■ 5.62
LARP4B-202ENST00000406525 NESP48681 1621 aa50.15■■■■■ 5.62
LARP4B-202ENST00000406525 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.08■■■■■ 5.61
LARP4B-202ENST00000406525 CUX2O14529 1486 aa49.89■■■■■ 5.58
LARP4B-202ENST00000406525 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.89■■■■■ 5.58
LARP4B-202ENST00000406525 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.88■■■■■ 5.58
LARP4B-202ENST00000406525 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.82■■■■■ 5.57
LARP4B-202ENST00000406525 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.78■■■■■ 5.56
LARP4B-202ENST00000406525 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.49■■■■■ 5.51
LARP4B-202ENST00000406525 CFTRP13569 1480 aa49.49■■■■■ 5.51
LARP4B-202ENST00000406525 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.49■■■■■ 5.51
LARP4B-202ENST00000406525 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.31■■■■■ 5.48
LARP4B-202ENST00000406525 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.25■■■■■ 5.48
LARP4B-202ENST00000406525 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.25■■■■■ 5.48
LARP4B-202ENST00000406525 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.24■■■■■ 5.47
LARP4B-202ENST00000406525 WDR62O43379 1518 aa49.09■■■■■ 5.45
LARP4B-202ENST00000406525 PRDM2Q13029 1718 aa48.91■■■■■ 5.42
LARP4B-202ENST00000406525 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.75■■■■■ 5.39
LARP4B-202ENST00000406525 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.64■■■■■ 5.38
LARP4B-202ENST00000406525 ABCC8Q09428 1581 aa48.49■■■■■ 5.35
LARP4B-202ENST00000406525 TOPBP1Q92547 1522 aa48.41■■■■■ 5.34
LARP4B-202ENST00000406525 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.3■■■■■ 5.32
LARP4B-202ENST00000406525 IFT140Q96RY7 1462 aa48.26■■■■■ 5.32
LARP4B-202ENST00000406525 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.98■■■■■ 5.27
LARP4B-202ENST00000406525 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.97■■■■■ 5.27
LARP4B-202ENST00000406525 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.89■■■■■ 5.26
LARP4B-202ENST00000406525 CUX1P39880 1505 aa47.85■■■■■ 5.25
LARP4B-202ENST00000406525 SOGA1O94964 1423 aa47.81■■■■■ 5.24
LARP4B-202ENST00000406525 OSCARQ8IYS5 282 aa47.78■■■■■ 5.24
LARP4B-202ENST00000406525 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.77■■■■■ 5.24
LARP4B-202ENST00000406525 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.75■■■■■ 5.24
LARP4B-202ENST00000406525 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.72■■■■■ 5.23
LARP4B-202ENST00000406525 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.69■■■■■ 5.222e-7■■■■□ 25.3
LARP4B-202ENST00000406525 TRIM41Q8WV44 630 aa47.64■■■■■ 5.22
LARP4B-202ENST00000406525 WDR97A6NE52 1622 aa47.59■■■■■ 5.21
LARP4B-202ENST00000406525 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.55■■■■■ 5.2
LARP4B-202ENST00000406525 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.45■■■■■ 5.19
LARP4B-202ENST00000406525 TOP2BQ02880 1626 aa47.35■■■■■ 5.17
LARP4B-202ENST00000406525 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.35■■■■■ 5.17
LARP4B-202ENST00000406525 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.31■■■■■ 5.16
LARP4B-202ENST00000406525 GRIN2BQ13224 1484 aa47.31■■■■■ 5.16
LARP4B-202ENST00000406525 SYNJ1O43426 1573 aa47.24■■■■■ 5.15
LARP4B-202ENST00000406525 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.23■■■■■ 5.15
LARP4B-202ENST00000406525 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.23■■■■■ 5.15
LARP4B-202ENST00000406525 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.22■■■■■ 5.15
LARP4B-202ENST00000406525 FBLN2P98095 1184 aa47.21■■■■■ 5.15
LARP4B-202ENST00000406525 CHD1O14646 1710 aa47.16■■■■■ 5.14
LARP4B-202ENST00000406525 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.12■■■■■ 5.13
LARP4B-202ENST00000406525 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.09■■■■■ 5.13
LARP4B-202ENST00000406525 SYNJ2O15056 1496 aa47.04■■■■■ 5.12
LARP4B-202ENST00000406525 PBRM1Q86U86 1689 aa47.02■■■■■ 5.12
LARP4B-202ENST00000406525 ARHGEF11O15085 1522 aa46.89■■■■■ 5.1
LARP4B-202ENST00000406525 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.89■■■■■ 5.1
LARP4B-202ENST00000406525 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.89■■■■■ 5.1
LARP4B-202ENST00000406525 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.89■■■■■ 5.1
LARP4B-202ENST00000406525 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.78■■■■■ 5.08
LARP4B-202ENST00000406525 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.77■■■■■ 5.08
LARP4B-202ENST00000406525 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.71■■■■■ 5.07
LARP4B-202ENST00000406525 ADAMTS12P58397 1594 aa46.69■■■■■ 5.07
LARP4B-202ENST00000406525 GRIN2AQ12879 1464 aa46.66■■■■■ 5.06
LARP4B-202ENST00000406525 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.52■■■■■ 5.04
LARP4B-202ENST00000406525 KIF27Q86VH2 1401 aa46.52■■■■■ 5.04
LARP4B-202ENST00000406525 NUP160Q12769 1436 aa46.51■■■■■ 5.04
LARP4B-202ENST00000406525 ARAP1Q96P48 1450 aa46.48■■■■■ 5.03
LARP4B-202ENST00000406525 IGF1RP08069 1367 aa46.39■■■■■ 5.02
LARP4B-202ENST00000406525 CEP170Q5SW79 1584 aa46.39■■■■■ 5.02
LARP4B-202ENST00000406525 CUL7Q14999 1698 aa46.21■■■■■ 4.99
LARP4B-202ENST00000406525 SHROOM2Q13796 1616 aa46.14■■■■■ 4.98
LARP4B-202ENST00000406525 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa46.09■■■■■ 4.97
LARP4B-202ENST00000406525 JPH4Q96JJ6 628 aa46.06■■■■■ 4.96
LARP4B-202ENST00000406525 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46■■■■■ 4.95
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