Protein–RNA interactions for Protein: Q12377

RPN6, 26S proteasome regulatory subunit RPN6, yeastyeast

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN6Q12377 TMA23YMR269W 636 nt8.52□□□□□ -1.05
RPN6Q12377 ERG13YML126C 1476 nt8.51□□□□□ -1.05
RPN6Q12377 RRT8YOL048C 1029 nt8.49□□□□□ -1.05
RPN6Q12377 ADH1YOL086C 1047 nt8.49□□□□□ -1.05
RPN6Q12377 CWP2YKL096W-A 279 nt8.48□□□□□ -1.05
RPN6Q12377 URA8YJR103W 1737 nt8.48□□□□□ -1.05
RPN6Q12377 IMO32YGR031W 1029 nt8.47□□□□□ -1.05
RPN6Q12377 LSR1LSR1 1175 nt8.47□□□□□ -1.05
RPN6Q12377 ITR2YOL103W 1830 nt8.47□□□□□ -1.05
RPN6Q12377 SAC7YDR389W 1965 nt8.46□□□□□ -1.05
RPN6Q12377 RPD3YNL330C 1302 nt8.46□□□□□ -1.06
RPN6Q12377 YRF1-2YER190W 5046 nt8.44□□□□□ -1.06
RPN6Q12377 VMA11YPL234C 495 nt8.44□□□□□ -1.06
RPN6Q12377 YHR218WYHR218W 1812 nt8.43□□□□□ -1.06
RPN6Q12377 HXK1YFR053C 1458 nt8.43□□□□□ -1.06
RPN6Q12377 MDM35YKL053C-A 261 nt8.42□□□□□ -1.06
RPN6Q12377 DAK2YFL053W 1776 nt8.42□□□□□ -1.06
RPN6Q12377 GAL2YLR081W 1725 nt8.41□□□□□ -1.06
RPN6Q12377 TIM44YIL022W 1296 nt8.41□□□□□ -1.06
RPN6Q12377 ALD5YER073W 1563 nt8.4□□□□□ -1.06
RPN6Q12377 TIP1YBR067C 633 nt8.4□□□□□ -1.06
RPN6Q12377 ADE8YDR408C 645 nt8.39□□□□□ -1.07
RPN6Q12377 YJR114WYJR114W 393 nt8.38□□□□□ -1.07
RPN6Q12377 TOK1YJL093C 2076 nt8.38□□□□□ -1.07
RPN6Q12377 SNZ1YMR096W 894 nt8.37□□□□□ -1.07
RPN6Q12377 YMR262WYMR262W 942 nt8.37□□□□□ -1.07
RPN6Q12377 YNR064CYNR064C 873 nt8.37□□□□□ -1.07
RPN6Q12377 YPR126CYPR126C 309 nt8.37□□□□□ -1.07
RPN6Q12377 CCT5YJR064W 1689 nt8.37□□□□□ -1.07
RPN6Q12377 KRR1YCL059C 951 nt8.36□□□□□ -1.07
RPN6Q12377 YJL195CYJL195C 702 nt8.36□□□□□ -1.07
RPN6Q12377 SNX3YOR357C 489 nt8.36□□□□□ -1.07
RPN6Q12377 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt8.34□□□□□ -1.07
RPN6Q12377 ELO1YJL196C 933 nt8.34□□□□□ -1.07
RPN6Q12377 RPC31YNL151C 756 nt8.34□□□□□ -1.07
RPN6Q12377 HXT10YFL011W 1641 nt8.33□□□□□ -1.08
RPN6Q12377 OPI3YJR073C 621 nt8.33□□□□□ -1.08
RPN6Q12377 YMR265CYMR265C 1386 nt8.33□□□□□ -1.08
RPN6Q12377 RIM2YBR192W 1134 nt8.32□□□□□ -1.08
RPN6Q12377 HEM14YER014W 1620 nt8.32□□□□□ -1.08
RPN6Q12377 TVP23YDR084C 600 nt8.31□□□□□ -1.08
RPN6Q12377 PCP1YGR101W 1041 nt8.31□□□□□ -1.08
RPN6Q12377 IML3YBR107C 738 nt8.31□□□□□ -1.08
RPN6Q12377 THI72YOR192C 1800 nt8.31□□□□□ -1.08
RPN6Q12377 KEL3YPL263C 1956 nt8.3□□□□□ -1.08
RPN6Q12377 SPS100YHR139C 981 nt8.3□□□□□ -1.08
RPN6Q12377 YOR072WYOR072W 315 nt8.3□□□□□ -1.08
RPN6Q12377 HAP5YOR358W 729 nt8.3□□□□□ -1.08
RPN6Q12377 SUV3YPL029W 2214 nt8.3□□□□□ -1.08
RPN6Q12377 DPL1YDR294C 1770 nt8.3□□□□□ -1.08
RPN6Q12377 CTI6YPL181W 1521 nt8.29□□□□□ -1.08
RPN6Q12377 RPN14YGL004C 1254 nt8.28□□□□□ -1.08
RPN6Q12377 FUN14YAL008W 597 nt8.28□□□□□ -1.08
RPN6Q12377 YEL008WYEL008W 381 nt8.26□□□□□ -1.09
RPN6Q12377 AGP3YFL055W 1677 nt8.25□□□□□ -1.09
RPN6Q12377 SFL1YOR140W 2301 nt8.24□□□□□ -1.09
RPN6Q12377 snR31snR31 225 nt8.24□□□□□ -1.09
RPN6Q12377 ABZ2YMR289W 1125 nt8.23□□□□□ -1.09
RPN6Q12377 SWT21YNL187W 1074 nt8.23□□□□□ -1.09
RPN6Q12377 MHF1YOL086W-A 273 nt8.23□□□□□ -1.09
RPN6Q12377 LEU4YNL104C 1860 nt8.22□□□□□ -1.09
RPN6Q12377 INH1YDL181W 258 nt8.22□□□□□ -1.09
RPN6Q12377 CRC1YOR100C 984 nt8.21□□□□□ -1.1
RPN6Q12377 MET1YKR069W 1782 nt8.2□□□□□ -1.1
RPN6Q12377 TAF13YML098W 504 nt8.19□□□□□ -1.1
RPN6Q12377 NBA1YOL070C 1506 nt8.19□□□□□ -1.1
RPN6Q12377 AMF1YOR378W 1548 nt8.19□□□□□ -1.1
RPN6Q12377 POT1YIL160C 1254 nt8.17□□□□□ -1.1
RPN6Q12377 MEX67YPL169C 1800 nt8.17□□□□□ -1.1
RPN6Q12377 YDR467CYDR467C 327 nt8.16□□□□□ -1.1
RPN6Q12377 ENO2YHR174W 1314 nt8.16□□□□□ -1.1
RPN6Q12377 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.15□□□□□ -1.1
RPN6Q12377 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.15□□□□□ -1.1
RPN6Q12377 KGD2YDR148C 1392 nt8.13□□□□□ -1.11
RPN6Q12377 YKL053WYKL053W 375 nt8.13□□□□□ -1.11
RPN6Q12377 NPP2YEL016C 1482 nt8.12□□□□□ -1.11
RPN6Q12377 STE4YOR212W 1272 nt8.11□□□□□ -1.11
RPN6Q12377 TPC1YGR096W 945 nt8.1□□□□□ -1.11
RPN6Q12377 GPM1YKL152C 744 nt8.1□□□□□ -1.11
RPN6Q12377 SAN1YDR143C 1833 nt8.09□□□□□ -1.11
RPN6Q12377 LEU2YCL018W 1095 nt8.09□□□□□ -1.11
RPN6Q12377 MDL2YPL270W 2322 nt8.09□□□□□ -1.11
RPN6Q12377 FRA1YLL029W 2250 nt8.08□□□□□ -1.12
RPN6Q12377 YLR349WYLR349W 507 nt8.08□□□□□ -1.12
RPN6Q12377 NIF3YGL221C 867 nt8.07□□□□□ -1.12
RPN6Q12377 SBP1YHL034C 885 nt8.07□□□□□ -1.12
RPN6Q12377 GSF2YML048W 1212 nt8.07□□□□□ -1.12
RPN6Q12377 YBL095WYBL095W 813 nt8.07□□□□□ -1.12
RPN6Q12377 THI3YDL080C 1830 nt8.06□□□□□ -1.12
RPN6Q12377 TUB4YLR212C 1422 nt8.06□□□□□ -1.12
RPN6Q12377 CPD1YGR247W 720 nt8.06□□□□□ -1.12
RPN6Q12377 GGA2YHR108W 1758 nt8.06□□□□□ -1.12
RPN6Q12377 MTO1YGL236C 2010 nt8.05□□□□□ -1.12
RPN6Q12377 FET5YFL041W 1869 nt8.05□□□□□ -1.12
RPN6Q12377 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt8.05□□□□□ -1.12
RPN6Q12377 MIM1YOL026C 342 nt8.05□□□□□ -1.12
RPN6Q12377 NAM8YHR086W 1572 nt8.05□□□□□ -1.12
RPN6Q12377 RSC4YKR008W 1878 nt8.04□□□□□ -1.12
RPN6Q12377 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8.04□□□□□ -1.12
RPN6Q12377 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.04□□□□□ -1.12
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