Protein–RNA interactions for Protein: Q08004

BUD20, Bud site selection protein 20, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BUD20Q08004 RPL4BYDR012W 1089 nt9.86□□□□□ -0.83
BUD20Q08004 YGR168CYGR168C 1131 nt9.86□□□□□ -0.83
BUD20Q08004 RPL4AYBR031W 1089 nt9.86□□□□□ -0.83
BUD20Q08004 HAT1YPL001W 1125 nt9.85□□□□□ -0.83
BUD20Q08004 YPR150WYPR150W 522 nt9.85□□□□□ -0.83
BUD20Q08004 BUD16YEL029C 939 nt9.84□□□□□ -0.83
BUD20Q08004 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt9.84□□□□□ -0.83
BUD20Q08004 RPS14BYJL191W 417 nt9.84□□□□□ -0.83
BUD20Q08004 DIF1YLR437C 402 nt9.84□□□□□ -0.83
BUD20Q08004 YBR292CYBR292C 372 nt9.84□□□□□ -0.83
BUD20Q08004 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.84□□□□□ -0.83
BUD20Q08004 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.84□□□□□ -0.83
BUD20Q08004 SUT1YGL162W 900 nt9.82□□□□□ -0.84
BUD20Q08004 UTH1YKR042W 1098 nt9.82□□□□□ -0.84
BUD20Q08004 NRT1YOR071C 1797 nt9.81□□□□□ -0.84
BUD20Q08004 MET28YIR017C 564 nt9.81□□□□□ -0.84
BUD20Q08004 RSF1YMR030W 1131 nt9.81□□□□□ -0.84
BUD20Q08004 RCE1YMR274C 948 nt9.81□□□□□ -0.84
BUD20Q08004 OCA1YNL099C 717 nt9.81□□□□□ -0.84
BUD20Q08004 PEX22YAL055W 543 nt9.8□□□□□ -0.84
BUD20Q08004 NMD4YLR363C 657 nt9.8□□□□□ -0.84
BUD20Q08004 CWC25YNL245C 540 nt9.8□□□□□ -0.84
BUD20Q08004 ARC35YNR035C 1029 nt9.8□□□□□ -0.84
BUD20Q08004 DSE3YOR264W 1293 nt9.8□□□□□ -0.84
BUD20Q08004 SVF1YDR346C 1446 nt9.8□□□□□ -0.84
BUD20Q08004 RAI1YGL246C 1164 nt9.79□□□□□ -0.84
BUD20Q08004 HIF1YLL022C 1158 nt9.79□□□□□ -0.84
BUD20Q08004 RRS1YOR294W 612 nt9.79□□□□□ -0.84
BUD20Q08004 PBP1YGR178C 2169 nt9.78□□□□□ -0.84
BUD20Q08004 DAL2YIR029W 1032 nt9.78□□□□□ -0.84
BUD20Q08004 CTK2YJL006C 972 nt9.78□□□□□ -0.84
BUD20Q08004 YNL165WYNL165W 1221 nt9.78□□□□□ -0.84
BUD20Q08004 PRE2YPR103W 864 nt9.78□□□□□ -0.84
BUD20Q08004 RTG3YBL103C 1461 nt9.78□□□□□ -0.84
BUD20Q08004 ALD4YOR374W 1560 nt9.77□□□□□ -0.85
BUD20Q08004 HMRA1YCR097W 381 nt9.77□□□□□ -0.85
BUD20Q08004 NAR1YNL240C 1476 nt9.76□□□□□ -0.85
BUD20Q08004 ALG7YBR243C 1347 nt9.76□□□□□ -0.85
BUD20Q08004 GLR1YPL091W 1452 nt9.75□□□□□ -0.85
BUD20Q08004 KRE28YDR532C 1158 nt9.75□□□□□ -0.85
BUD20Q08004 VAM3YOR106W 852 nt9.75□□□□□ -0.85
BUD20Q08004 RAD17YOR368W 1206 nt9.75□□□□□ -0.85
BUD20Q08004 YIF1YNL263C 945 nt9.74□□□□□ -0.85
BUD20Q08004 TGS1YPL157W 948 nt9.74□□□□□ -0.85
BUD20Q08004 MCH5YOR306C 1566 nt9.73□□□□□ -0.85
BUD20Q08004 SAM35YHR083W 990 nt9.73□□□□□ -0.85
BUD20Q08004 JJJ3YJR097W 519 nt9.73□□□□□ -0.85
BUD20Q08004 YAR028WYAR028W 705 nt9.73□□□□□ -0.85
BUD20Q08004 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt9.73□□□□□ -0.85
BUD20Q08004 YMR244WYMR244W 1068 nt9.73□□□□□ -0.85
BUD20Q08004 YKR104WYKR104W 921 nt9.71□□□□□ -0.86
BUD20Q08004 YLR198CYLR198C 360 nt9.71□□□□□ -0.86
BUD20Q08004 MER1YNL210W 813 nt9.71□□□□□ -0.86
BUD20Q08004 MTG2YHR168W 1557 nt9.71□□□□□ -0.86
BUD20Q08004 RRP17YDR412W 708 nt9.7□□□□□ -0.86
BUD20Q08004 YHR022CYHR022C 771 nt9.7□□□□□ -0.86
BUD20Q08004 CYT2YKL087C 675 nt9.7□□□□□ -0.86
BUD20Q08004 DSC2YOL073C 969 nt9.7□□□□□ -0.86
BUD20Q08004 ISA2YPR067W 558 nt9.7□□□□□ -0.86
BUD20Q08004 YEA4YEL004W 1029 nt9.69□□□□□ -0.86
BUD20Q08004 MHO1YJR008W 1017 nt9.69□□□□□ -0.86
BUD20Q08004 CBS1YDL069C 690 nt9.68□□□□□ -0.86
BUD20Q08004 FIT3YOR383C 615 nt9.68□□□□□ -0.86
BUD20Q08004 RRP15YPR143W 753 nt9.68□□□□□ -0.86
BUD20Q08004 OCA4YCR095C 1089 nt9.67□□□□□ -0.86
BUD20Q08004 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.67□□□□□ -0.86
BUD20Q08004 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.67□□□□□ -0.86
BUD20Q08004 FSH1YHR049W 732 nt9.67□□□□□ -0.86
BUD20Q08004 YLR279WYLR279W 390 nt9.67□□□□□ -0.86
BUD20Q08004 YLR460CYLR460C 1131 nt9.67□□□□□ -0.86
BUD20Q08004 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.67□□□□□ -0.86
BUD20Q08004 VPS20YMR077C 666 nt9.67□□□□□ -0.86
BUD20Q08004 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.67□□□□□ -0.86
BUD20Q08004 SDH5YOL071W 489 nt9.67□□□□□ -0.86
BUD20Q08004 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.67□□□□□ -0.86
BUD20Q08004 TFB4YPR056W 1017 nt9.67□□□□□ -0.86
BUD20Q08004 TSC10YBR265W 963 nt9.67□□□□□ -0.86
BUD20Q08004 DBP1YPL119C 1854 nt9.67□□□□□ -0.86
BUD20Q08004 AKR2YOR034C 2250 nt9.66□□□□□ -0.86
BUD20Q08004 RPF2YKR081C 1035 nt9.66□□□□□ -0.86
BUD20Q08004 YAP7YOL028C 738 nt9.65□□□□□ -0.86
BUD20Q08004 YGR012WYGR012W 1182 nt9.64□□□□□ -0.87
BUD20Q08004 LIP1YMR298W 453 nt9.64□□□□□ -0.87
BUD20Q08004 MGR3YMR115W 1506 nt9.64□□□□□ -0.87
BUD20Q08004 YKR015CYKR015C 1707 nt9.64□□□□□ -0.87
BUD20Q08004 ALP1YNL270C 1722 nt9.64□□□□□ -0.87
BUD20Q08004 CAB5YDR196C 726 nt9.63□□□□□ -0.87
BUD20Q08004 NAS6YGR232W 687 nt9.63□□□□□ -0.87
BUD20Q08004 REX3YLR107W 1215 nt9.63□□□□□ -0.87
BUD20Q08004 YNL228WYNL228W 777 nt9.63□□□□□ -0.87
BUD20Q08004 YIL092WYIL092W 1902 nt9.62□□□□□ -0.87
BUD20Q08004 HXT1YHR094C 1713 nt9.62□□□□□ -0.87
BUD20Q08004 MSB4YOL112W 1479 nt9.62□□□□□ -0.87
BUD20Q08004 SED1YDR077W 1017 nt9.62□□□□□ -0.87
BUD20Q08004 PTC7YHR076W 1032 nt9.62□□□□□ -0.87
BUD20Q08004 RRP40YOL142W 723 nt9.62□□□□□ -0.87
BUD20Q08004 CHA1YCL064C 1083 nt9.61□□□□□ -0.87
BUD20Q08004 TRP4YDR354W 1143 nt9.61□□□□□ -0.87
BUD20Q08004 RMA1YKL132C 1293 nt9.61□□□□□ -0.87
BUD20Q08004 FES1YBR101C 873 nt9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.2 ms