Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

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Length 712 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 LOT5YKL183W 921 nt7.93□□□□□ -1.14
SSK1Q07084 TIP1YBR067C 633 nt7.93□□□□□ -1.14
SSK1Q07084 HXT12YIL170W 1374 nt7.93□□□□□ -1.14
SSK1Q07084 YJL118WYJL118W 660 nt7.92□□□□□ -1.14
SSK1Q07084 YOR072WYOR072W 315 nt7.92□□□□□ -1.14
SSK1Q07084 RPT5YOR117W 1305 nt7.92□□□□□ -1.14
SSK1Q07084 SAC7YDR389W 1965 nt7.91□□□□□ -1.14
SSK1Q07084 OYE2YHR179W 1203 nt7.91□□□□□ -1.14
SSK1Q07084 ADH1YOL086C 1047 nt7.91□□□□□ -1.14
SSK1Q07084 LSB5YCL034W 1065 nt7.91□□□□□ -1.14
SSK1Q07084 RAD51YER095W 1203 nt7.9□□□□□ -1.14
SSK1Q07084 YMR262WYMR262W 942 nt7.9□□□□□ -1.14
SSK1Q07084 YPI1YFR003C 468 nt7.89□□□□□ -1.15
SSK1Q07084 PCP1YGR101W 1041 nt7.89□□□□□ -1.15
SSK1Q07084 YNR029CYNR029C 1290 nt7.89□□□□□ -1.15
SSK1Q07084 VMA11YPL234C 495 nt7.89□□□□□ -1.15
SSK1Q07084 TPS1YBR126C 1488 nt7.88□□□□□ -1.15
SSK1Q07084 AGP3YFL055W 1677 nt7.88□□□□□ -1.15
SSK1Q07084 YJL055WYJL055W 738 nt7.87□□□□□ -1.15
SSK1Q07084 ERG13YML126C 1476 nt7.87□□□□□ -1.15
SSK1Q07084 GAL3YDR009W 1563 nt7.86□□□□□ -1.15
SSK1Q07084 LSM5YER146W 282 nt7.86□□□□□ -1.15
SSK1Q07084 DPL1YDR294C 1770 nt7.86□□□□□ -1.15
SSK1Q07084 YJL195CYJL195C 702 nt7.85□□□□□ -1.15
SSK1Q07084 TMA23YMR269W 636 nt7.85□□□□□ -1.15
SSK1Q07084 RRT8YOL048C 1029 nt7.85□□□□□ -1.15
SSK1Q07084 FUN14YAL008W 597 nt7.84□□□□□ -1.15
SSK1Q07084 YLR349WYLR349W 507 nt7.84□□□□□ -1.15
SSK1Q07084 RPC31YNL151C 756 nt7.84□□□□□ -1.15
SSK1Q07084 RIM2YBR192W 1134 nt7.84□□□□□ -1.15
SSK1Q07084 LSB3YFR024C-A 1380 nt7.84□□□□□ -1.16
SSK1Q07084 MTO1YGL236C 2010 nt7.83□□□□□ -1.16
SSK1Q07084 DDI1YER143W 1287 nt7.83□□□□□ -1.16
SSK1Q07084 SNX3YOR357C 489 nt7.83□□□□□ -1.16
SSK1Q07084 NBA1YOL070C 1506 nt7.83□□□□□ -1.16
SSK1Q07084 INH1YDL181W 258 nt7.82□□□□□ -1.16
SSK1Q07084 KRR1YCL059C 951 nt7.81□□□□□ -1.16
SSK1Q07084 VRG4YGL225W 1014 nt7.81□□□□□ -1.16
SSK1Q07084 STE4YOR212W 1272 nt7.81□□□□□ -1.16
SSK1Q07084 RIB2YOL066C 1776 nt7.8□□□□□ -1.16
SSK1Q07084 IMO32YGR031W 1029 nt7.8□□□□□ -1.16
SSK1Q07084 LEU4YNL104C 1860 nt7.78□□□□□ -1.16
SSK1Q07084 MEX67YPL169C 1800 nt7.78□□□□□ -1.16
SSK1Q07084 FRA1YLL029W 2250 nt7.77□□□□□ -1.17
SSK1Q07084 RIB7YBR153W 735 nt7.77□□□□□ -1.17
SSK1Q07084 MDL2YPL270W 2322 nt7.77□□□□□ -1.17
SSK1Q07084 SUV3YPL029W 2214 nt7.75□□□□□ -1.17
SSK1Q07084 YMR265CYMR265C 1386 nt7.74□□□□□ -1.17
SSK1Q07084 YDR467CYDR467C 327 nt7.74□□□□□ -1.17
SSK1Q07084 YEL008WYEL008W 381 nt7.74□□□□□ -1.17
SSK1Q07084 ELO1YJL196C 933 nt7.74□□□□□ -1.17
SSK1Q07084 DAK2YFL053W 1776 nt7.74□□□□□ -1.17
SSK1Q07084 OPI3YJR073C 621 nt7.73□□□□□ -1.17
SSK1Q07084 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.72□□□□□ -1.17
SSK1Q07084 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.72□□□□□ -1.17
SSK1Q07084 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.72□□□□□ -1.17
SSK1Q07084 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.72□□□□□ -1.17
SSK1Q07084 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.72□□□□□ -1.17
SSK1Q07084 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.72□□□□□ -1.17
SSK1Q07084 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.72□□□□□ -1.17
SSK1Q07084 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.72□□□□□ -1.17
SSK1Q07084 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.72□□□□□ -1.17
SSK1Q07084 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.72□□□□□ -1.17
SSK1Q07084 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.72□□□□□ -1.17
SSK1Q07084 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.72□□□□□ -1.17
SSK1Q07084 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.72□□□□□ -1.17
SSK1Q07084 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.72□□□□□ -1.17
SSK1Q07084 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.72□□□□□ -1.17
SSK1Q07084 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt7.72□□□□□ -1.17
SSK1Q07084 MIM1YOL026C 342 nt7.72□□□□□ -1.17
SSK1Q07084 SFL1YOR140W 2301 nt7.72□□□□□ -1.17
SSK1Q07084 RSC4YKR008W 1878 nt7.71□□□□□ -1.18
SSK1Q07084 YNR064CYNR064C 873 nt7.71□□□□□ -1.18
SSK1Q07084 NPP2YEL016C 1482 nt7.7□□□□□ -1.18
SSK1Q07084 YJR114WYJR114W 393 nt7.7□□□□□ -1.18
SSK1Q07084 FET5YFL041W 1869 nt7.7□□□□□ -1.18
SSK1Q07084 SNZ1YMR096W 894 nt7.69□□□□□ -1.18
SSK1Q07084 HAP5YOR358W 729 nt7.69□□□□□ -1.18
SSK1Q07084 RPN14YGL004C 1254 nt7.68□□□□□ -1.18
SSK1Q07084 YPR126CYPR126C 309 nt7.68□□□□□ -1.18
SSK1Q07084 ADH7YCR105W 1086 nt7.67□□□□□ -1.18
SSK1Q07084 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.67□□□□□ -1.18
SSK1Q07084 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.67□□□□□ -1.18
SSK1Q07084 ADE8YDR408C 645 nt7.67□□□□□ -1.18
SSK1Q07084 KEL3YPL263C 1956 nt7.67□□□□□ -1.18
SSK1Q07084 TVP23YDR084C 600 nt7.66□□□□□ -1.18
SSK1Q07084 MET8YBR213W 825 nt7.66□□□□□ -1.18
SSK1Q07084 SWT21YNL187W 1074 nt7.65□□□□□ -1.18
SSK1Q07084 CRC1YOR100C 984 nt7.64□□□□□ -1.19
SSK1Q07084 CCT5YJR064W 1689 nt7.63□□□□□ -1.19
SSK1Q07084 TRP2YER090W 1524 nt7.63□□□□□ -1.19
SSK1Q07084 CPD1YGR247W 720 nt7.63□□□□□ -1.19
SSK1Q07084 PAU15YIR041W 375 nt7.63□□□□□ -1.19
SSK1Q07084 YJR154WYJR154W 1041 nt7.61□□□□□ -1.19
SSK1Q07084 YBL095WYBL095W 813 nt7.61□□□□□ -1.19
SSK1Q07084 HBS1YKR084C 1836 nt7.61□□□□□ -1.19
SSK1Q07084 MET1YKR069W 1782 nt7.61□□□□□ -1.19
SSK1Q07084 MCM5YLR274W 2328 nt7.6□□□□□ -1.19
SSK1Q07084 THI6YPL214C 1623 nt7.6□□□□□ -1.19
SSK1Q07084 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt7.59□□□□□ -1.19
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