Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 PSD1YNL169C 1503 nt9.56□□□□□ -0.88
SHQ1P40486 SAC7YDR389W 1965 nt9.55□□□□□ -0.88
SHQ1P40486 CCT5YJR064W 1689 nt9.55□□□□□ -0.88
SHQ1P40486 ACO2YJL200C 2370 nt9.52□□□□□ -0.88
SHQ1P40486 RPD3YNL330C 1302 nt9.52□□□□□ -0.89
SHQ1P40486 IMO32YGR031W 1029 nt9.51□□□□□ -0.89
SHQ1P40486 CWP2YKL096W-A 279 nt9.5□□□□□ -0.89
SHQ1P40486 MDM35YKL053C-A 261 nt9.49□□□□□ -0.89
SHQ1P40486 TAF13YML098W 504 nt9.49□□□□□ -0.89
SHQ1P40486 RRT8YOL048C 1029 nt9.49□□□□□ -0.89
SHQ1P40486 TIP1YBR067C 633 nt9.49□□□□□ -0.89
SHQ1P40486 TIM44YIL022W 1296 nt9.48□□□□□ -0.89
SHQ1P40486 VMA11YPL234C 495 nt9.48□□□□□ -0.89
SHQ1P40486 SNZ1YMR096W 894 nt9.47□□□□□ -0.89
SHQ1P40486 YHR218WYHR218W 1812 nt9.47□□□□□ -0.89
SHQ1P40486 NAP1YKR048C 1254 nt9.46□□□□□ -0.9
SHQ1P40486 CYT1YOR065W 930 nt9.46□□□□□ -0.9
SHQ1P40486 ADE8YDR408C 645 nt9.45□□□□□ -0.9
SHQ1P40486 ELO1YJL196C 933 nt9.45□□□□□ -0.9
SHQ1P40486 DAK2YFL053W 1776 nt9.45□□□□□ -0.9
SHQ1P40486 THI72YOR192C 1800 nt9.45□□□□□ -0.9
SHQ1P40486 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt9.44□□□□□ -0.9
SHQ1P40486 STP3YLR375W 1032 nt9.44□□□□□ -0.9
SHQ1P40486 HXT10YFL011W 1641 nt9.43□□□□□ -0.9
SHQ1P40486 PAU5YFL020C 369 nt9.43□□□□□ -0.9
SHQ1P40486 SEN2YLR105C 1134 nt9.43□□□□□ -0.9
SHQ1P40486 YJR114WYJR114W 393 nt9.42□□□□□ -0.9
SHQ1P40486 SNX3YOR357C 489 nt9.42□□□□□ -0.9
SHQ1P40486 YMR262WYMR262W 942 nt9.41□□□□□ -0.9
SHQ1P40486 YNR064CYNR064C 873 nt9.41□□□□□ -0.9
SHQ1P40486 OPI3YJR073C 621 nt9.4□□□□□ -0.9
SHQ1P40486 PGC1YPL206C 966 nt9.4□□□□□ -0.9
SHQ1P40486 RPC31YNL151C 756 nt9.39□□□□□ -0.91
SHQ1P40486 YPR126CYPR126C 309 nt9.39□□□□□ -0.91
SHQ1P40486 YBR232CYBR232C 360 nt9.39□□□□□ -0.91
SHQ1P40486 DPL1YDR294C 1770 nt9.38□□□□□ -0.91
SHQ1P40486 RIM2YBR192W 1134 nt9.37□□□□□ -0.91
SHQ1P40486 SUV3YPL029W 2214 nt9.36□□□□□ -0.91
SHQ1P40486 MHF1YOL086W-A 273 nt9.36□□□□□ -0.91
SHQ1P40486 YMR265CYMR265C 1386 nt9.36□□□□□ -0.91
SHQ1P40486 YHL008CYHL008C 1884 nt9.35□□□□□ -0.91
SHQ1P40486 POT1YIL160C 1254 nt9.33□□□□□ -0.92
SHQ1P40486 HAP5YOR358W 729 nt9.33□□□□□ -0.92
SHQ1P40486 IML3YBR107C 738 nt9.33□□□□□ -0.92
SHQ1P40486 SFL1YOR140W 2301 nt9.33□□□□□ -0.92
SHQ1P40486 AGP3YFL055W 1677 nt9.32□□□□□ -0.92
SHQ1P40486 TVP23YDR084C 600 nt9.32□□□□□ -0.92
SHQ1P40486 GSF2YML048W 1212 nt9.32□□□□□ -0.92
SHQ1P40486 KEL3YPL263C 1956 nt9.32□□□□□ -0.92
SHQ1P40486 CTI6YPL181W 1521 nt9.31□□□□□ -0.92
SHQ1P40486 GID7YCL039W 2238 nt9.31□□□□□ -0.92
SHQ1P40486 SPS100YHR139C 981 nt9.31□□□□□ -0.92
SHQ1P40486 LEU4YNL104C 1860 nt9.3□□□□□ -0.92
SHQ1P40486 PAR32YDL173W 888 nt9.3□□□□□ -0.92
SHQ1P40486 PUP1YOR157C 786 nt9.29□□□□□ -0.92
SHQ1P40486 MET2YNL277W 1461 nt9.28□□□□□ -0.92
SHQ1P40486 KRR1YCL059C 951 nt9.28□□□□□ -0.92
SHQ1P40486 CRC1YOR100C 984 nt9.28□□□□□ -0.92
SHQ1P40486 SWT21YNL187W 1074 nt9.27□□□□□ -0.93
SHQ1P40486 RPN14YGL004C 1254 nt9.26□□□□□ -0.93
SHQ1P40486 YJL064WYJL064W 396 nt9.26□□□□□ -0.93
SHQ1P40486 MET1YKR069W 1782 nt9.26□□□□□ -0.93
SHQ1P40486 TUB4YLR212C 1422 nt9.24□□□□□ -0.93
SHQ1P40486 ABZ2YMR289W 1125 nt9.24□□□□□ -0.93
SHQ1P40486 SFP1YLR403W 2052 nt9.24□□□□□ -0.93
SHQ1P40486 NPP1YCR026C 2229 nt9.23□□□□□ -0.93
SHQ1P40486 PAU19YMR325W 375 nt9.23□□□□□ -0.93
SHQ1P40486 INH1YDL181W 258 nt9.21□□□□□ -0.94
SHQ1P40486 YKL053WYKL053W 375 nt9.21□□□□□ -0.94
SHQ1P40486 YDR467CYDR467C 327 nt9.2□□□□□ -0.94
SHQ1P40486 PCP1YGR101W 1041 nt9.2□□□□□ -0.94
SHQ1P40486 snR31snR31 225 nt9.2□□□□□ -0.94
SHQ1P40486 NPP2YEL016C 1482 nt9.2□□□□□ -0.94
SHQ1P40486 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt9.19□□□□□ -0.94
SHQ1P40486 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt9.19□□□□□ -0.94
SHQ1P40486 ENO2YHR174W 1314 nt9.19□□□□□ -0.94
SHQ1P40486 AMF1YOR378W 1548 nt9.19□□□□□ -0.94
SHQ1P40486 KGD2YDR148C 1392 nt9.18□□□□□ -0.94
SHQ1P40486 NBA1YOL070C 1506 nt9.16□□□□□ -0.94
SHQ1P40486 BSP1YPR171W 1731 nt9.16□□□□□ -0.94
SHQ1P40486 TPO4YOR273C 1980 nt9.15□□□□□ -0.94
SHQ1P40486 TPC1YGR096W 945 nt9.15□□□□□ -0.94
SHQ1P40486 NIF3YGL221C 867 nt9.13□□□□□ -0.95
SHQ1P40486 APS2YJR058C 444 nt9.13□□□□□ -0.95
SHQ1P40486 GPM1YKL152C 744 nt9.13□□□□□ -0.95
SHQ1P40486 FET5YFL041W 1869 nt9.13□□□□□ -0.95
SHQ1P40486 THI3YDL080C 1830 nt9.11□□□□□ -0.95
SHQ1P40486 SAN1YDR143C 1833 nt9.11□□□□□ -0.95
SHQ1P40486 SLG1YOR008C 1137 nt9.09□□□□□ -0.95
SHQ1P40486 YBL095WYBL095W 813 nt9.08□□□□□ -0.96
SHQ1P40486 NAM8YHR086W 1572 nt9.07□□□□□ -0.96
SHQ1P40486 IGD1YFR017C 588 nt9.07□□□□□ -0.96
SHQ1P40486 KRE1YNL322C 942 nt9.07□□□□□ -0.96
SHQ1P40486 MTO1YGL236C 2010 nt9.06□□□□□ -0.96
SHQ1P40486 LEU2YCL018W 1095 nt9.06□□□□□ -0.96
SHQ1P40486 GGA2YHR108W 1758 nt9.06□□□□□ -0.96
SHQ1P40486 ESBP6YNL125C 2022 nt9.05□□□□□ -0.96
SHQ1P40486 SBP1YHL034C 885 nt9.05□□□□□ -0.96
SHQ1P40486 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt9.05□□□□□ -0.96
SHQ1P40486 TRP2YER090W 1524 nt9.05□□□□□ -0.96
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