Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPN1P04843 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RPN1P04843 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RPN1P04843 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RPN1P04843 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RPN1P04843 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RPN1P04843 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RPN1P04843 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RPN1P04843 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RPN1P04843 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RPN1P04843 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RPN1P04843 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RPN1P04843 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RPN1P04843 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RPN1P04843 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RPN1P04843 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RPN1P04843 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RPN1P04843 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RPN1P04843 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RPN1P04843 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RPN1P04843 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RPN1P04843 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RPN1P04843 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RPN1P04843 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RPN1P04843 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RPN1P04843 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RPN1P04843 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RPN1P04843 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPN1P04843 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPN1P04843 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPN1P04843 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RPN1P04843 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
RPN1P04843 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RPN1P04843 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RPN1P04843 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RPN1P04843 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RPN1P04843 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RPN1P04843 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPN1P04843 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RPN1P04843 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RPN1P04843 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RPN1P04843 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RPN1P04843 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RPN1P04843 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RPN1P04843 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RPN1P04843 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RPN1P04843 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RPN1P04843 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RPN1P04843 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RPN1P04843 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RPN1P04843 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RPN1P04843 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RPN1P04843 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RPN1P04843 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RPN1P04843 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RPN1P04843 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RPN1P04843 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RPN1P04843 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPN1P04843 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPN1P04843 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPN1P04843 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RPN1P04843 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RPN1P04843 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RPN1P04843 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPN1P04843 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPN1P04843 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPN1P04843 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPN1P04843 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPN1P04843 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RPN1P04843 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPN1P04843 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPN1P04843 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPN1P04843 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPN1P04843 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPN1P04843 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPN1P04843 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPN1P04843 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RPN1P04843 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RPN1P04843 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RPN1P04843 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RPN1P04843 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RPN1P04843 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RPN1P04843 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPN1P04843 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPN1P04843 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPN1P04843 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPN1P04843 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPN1P04843 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPN1P04843 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPN1P04843 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPN1P04843 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPN1P04843 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RPN1P04843 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPN1P04843 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPN1P04843 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPN1P04843 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RPN1P04843 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPN1P04843 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPN1P04843 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPN1P04843 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms