Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KCNQ3O43525 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
KCNQ3O43525 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KCNQ3O43525 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
KCNQ3O43525 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
KCNQ3O43525 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
KCNQ3O43525 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
KCNQ3O43525 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
KCNQ3O43525 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
KCNQ3O43525 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
KCNQ3O43525 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
KCNQ3O43525 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
KCNQ3O43525 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KCNQ3O43525 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
KCNQ3O43525 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KCNQ3O43525 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KCNQ3O43525 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
KCNQ3O43525 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
KCNQ3O43525 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
KCNQ3O43525 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
KCNQ3O43525 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
KCNQ3O43525 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
KCNQ3O43525 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
KCNQ3O43525 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
KCNQ3O43525 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
KCNQ3O43525 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.16■■■■□ 3.06
KCNQ3O43525 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KCNQ3O43525 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
KCNQ3O43525 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
KCNQ3O43525 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KCNQ3O43525 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KCNQ3O43525 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
KCNQ3O43525 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
KCNQ3O43525 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KCNQ3O43525 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
KCNQ3O43525 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
KCNQ3O43525 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KCNQ3O43525 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
KCNQ3O43525 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KCNQ3O43525 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
KCNQ3O43525 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
KCNQ3O43525 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
KCNQ3O43525 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
KCNQ3O43525 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
KCNQ3O43525 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
KCNQ3O43525 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
KCNQ3O43525 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KCNQ3O43525 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KCNQ3O43525 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
KCNQ3O43525 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KCNQ3O43525 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KCNQ3O43525 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
KCNQ3O43525 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
KCNQ3O43525 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KCNQ3O43525 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
KCNQ3O43525 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KCNQ3O43525 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KCNQ3O43525 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
KCNQ3O43525 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
KCNQ3O43525 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
KCNQ3O43525 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
KCNQ3O43525 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
KCNQ3O43525 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
KCNQ3O43525 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KCNQ3O43525 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KCNQ3O43525 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
KCNQ3O43525 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KCNQ3O43525 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
KCNQ3O43525 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KCNQ3O43525 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
KCNQ3O43525 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
KCNQ3O43525 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
KCNQ3O43525 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
KCNQ3O43525 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
KCNQ3O43525 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KCNQ3O43525 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KCNQ3O43525 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KCNQ3O43525 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KCNQ3O43525 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KCNQ3O43525 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KCNQ3O43525 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KCNQ3O43525 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KCNQ3O43525 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
KCNQ3O43525 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
KCNQ3O43525 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
KCNQ3O43525 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
KCNQ3O43525 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
KCNQ3O43525 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
KCNQ3O43525 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
KCNQ3O43525 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
KCNQ3O43525 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
KCNQ3O43525 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KCNQ3O43525 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KCNQ3O43525 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KCNQ3O43525 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KCNQ3O43525 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KCNQ3O43525 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KCNQ3O43525 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
KCNQ3O43525 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
KCNQ3O43525 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms