Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ARFGEF2Q9Y6D5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARFGEF2Q9Y6D5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARFGEF2Q9Y6D5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARFGEF2Q9Y6D5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARFGEF2Q9Y6D5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARFGEF2Q9Y6D5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARFGEF2Q9Y6D5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARFGEF2Q9Y6D5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARFGEF2Q9Y6D5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARFGEF2Q9Y6D5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARFGEF2Q9Y6D5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARFGEF2Q9Y6D5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms