Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X0

DPM3, Dolichol-phosphate mannosyltransferase subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPM3Q9P2X0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DPM3Q9P2X0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPM3Q9P2X0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms