Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms