Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPRYD3Q8NCJ5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms