Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNE4Q8N205 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms