Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms