Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKN3Q16667 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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