Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD1Q15797 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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