Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SS18Q15532 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SS18Q15532 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SS18Q15532 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SS18Q15532 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SS18Q15532 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SS18Q15532 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SS18Q15532 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SS18Q15532 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SS18Q15532 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SS18Q15532 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SS18Q15532 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SS18Q15532 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SS18Q15532 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SS18Q15532 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SS18Q15532 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SS18Q15532 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SS18Q15532 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SS18Q15532 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SS18Q15532 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SS18Q15532 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SS18Q15532 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SS18Q15532 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SS18Q15532 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SS18Q15532 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SS18Q15532 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SS18Q15532 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SS18Q15532 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SS18Q15532 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SS18Q15532 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SS18Q15532 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SS18Q15532 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SS18Q15532 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SS18Q15532 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SS18Q15532 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SS18Q15532 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SS18Q15532 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SS18Q15532 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SS18Q15532 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SS18Q15532 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SS18Q15532 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SS18Q15532 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SS18Q15532 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SS18Q15532 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SS18Q15532 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SS18Q15532 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SS18Q15532 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SS18Q15532 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SS18Q15532 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SS18Q15532 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SS18Q15532 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SS18Q15532 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SS18Q15532 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SS18Q15532 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SS18Q15532 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SS18Q15532 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SS18Q15532 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SS18Q15532 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SS18Q15532 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SS18Q15532 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SS18Q15532 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SS18Q15532 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SS18Q15532 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SS18Q15532 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SS18Q15532 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SS18Q15532 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SS18Q15532 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SS18Q15532 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SS18Q15532 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SS18Q15532 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SS18Q15532 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SS18Q15532 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SS18Q15532 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SS18Q15532 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SS18Q15532 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SS18Q15532 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SS18Q15532 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SS18Q15532 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SS18Q15532 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SS18Q15532 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SS18Q15532 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SS18Q15532 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SS18Q15532 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SS18Q15532 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SS18Q15532 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SS18Q15532 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SS18Q15532 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SS18Q15532 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SS18Q15532 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SS18Q15532 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SS18Q15532 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SS18Q15532 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SS18Q15532 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SS18Q15532 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SS18Q15532 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SS18Q15532 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SS18Q15532 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SS18Q15532 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SS18Q15532 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SS18Q15532 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms