Protein–RNA interactions for Protein: Q12504

RKM4, Ribosomal lysine N-methyltransferase 4, yeastyeast

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RKM4Q12504 SMC3YJL074C 3693 nt3.52□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 HOP2YGL033W 657 nt3.52□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 SHE2YKL130C 741 nt3.52□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt3.52□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 SSY1YDR160W 2559 nt3.52□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 IOC3YFR013W 2364 nt3.51□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 YDL242WYDL242W 354 nt3.51□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 RMT2YDR465C 1239 nt3.51□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 CAJ1YER048C 1176 nt3.51□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 YMR320WYMR320W 306 nt3.51□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 PKH1YDR490C 2301 nt3.51□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 GIS4YML006C 2325 nt3.51□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 MYO5YMR109W 3660 nt3.51□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 COX1Q0045 1605 nt3.51□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 YNL034WYNL034W 1839 nt3.51□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 RPA190YOR341W 4995 nt3.51□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 SPO14YKR031C 5052 nt3.5□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 MAK21YDR060W 3078 nt3.5□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 EPL1YFL024C 2499 nt3.5□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 YHR078WYHR078W 1659 nt3.5□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 SIP3YNL257C 3690 nt3.5□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt3.5□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 APC11YDL008W 498 nt3.5□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 FAP7YDL166C 594 nt3.5□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 YDR250CYDR250C 276 nt3.5□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 HMF1YER057C 390 nt3.5□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 YFR056CYFR056C 369 nt3.5□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 PGA1YNL158W 597 nt3.5□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 TFC1YBR123C 1950 nt3.49□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 BMS1YPL217C 3552 nt3.49□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt3.49□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 RPL9BYNL067W 576 nt3.49□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 NPR1YNL183C 2373 nt3.48□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 BCH1YMR237W 2175 nt3.48□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 PEX4YGR133W 552 nt3.48□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 YIL058WYIL058W 285 nt3.48□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 YLR031WYLR031W 561 nt3.48□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 NTO1YPR031W 2247 nt3.48□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 FLO5YHR211W 3228 nt3.48□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 TPS2YDR074W 2691 nt3.47□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 SPP382YLR424W 2127 nt3.47□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 NCE101YJL205C 162 nt3.47□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 RPL8BYLL045C 771 nt3.47□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 ESF2YNR054C 951 nt3.47□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 IRC23YOR044W 474 nt3.47□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 ATP15YPL271W 189 nt3.47□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 ENA5YDR038C 3276 nt3.47□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 ECM5YMR176W 4236 nt3.46□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 YJL016WYJL016W 1686 nt3.46□□□□□ -1.85
RKM4Q12504 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt3.46□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 YER023C-AYER023C-A 213 nt3.46□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt3.46□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 COX7YMR256C 183 nt3.46□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 YBL073WYBL073W 312 nt3.46□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 GIS2YNL255C 462 nt3.46□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 YBP1YBR216C 2025 nt3.46□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 YMR317WYMR317W 3423 nt3.45□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 DOA4YDR069C 2781 nt3.45□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 MET10YFR030W 3108 nt3.45□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 SPO71YDR104C 3738 nt3.44□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 RPS17BYDR447C 411 nt3.44□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt3.44□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt3.44□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt3.44□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt3.44□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 COG3YER157W 2406 nt3.44□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 NUP82YJL061W 2142 nt3.44□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 MDV1YJL112W 2145 nt3.44□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 RGC1YPR115W 3252 nt3.44□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 LEU3YLR451W 2661 nt3.44□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 GYP7YDL234C 2241 nt3.43□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 VPS52YDR484W 1926 nt3.43□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 GCN4YEL009C 846 nt3.43□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 RPL30YGL030W 318 nt3.43□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 RPS21AYKR057W 264 nt3.43□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 RPL20BYOR312C 519 nt3.43□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 RIF1YBR275C 5751 nt3.43□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 TAO3YIL129C 7131 nt3.43□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 YPK1YKL126W 2043 nt3.43□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 RCY1YJL204C 2523 nt3.42□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 VTC4YJL012C 2166 nt3.42□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 DIA2YOR080W 2199 nt3.42□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 PCF11YDR228C 1881 nt3.42□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 TOM70YNL121C 1854 nt3.42□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 YMR31YFR049W 372 nt3.42□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 USE1YGL098W 738 nt3.42□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 RPN1YHR027C 2982 nt3.42□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 TMA22YJR014W 597 nt3.42□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 RPL26AYLR344W 384 nt3.42□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 YPL229WYPL229W 621 nt3.42□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt3.41□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt3.41□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt3.41□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt3.41□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt3.41□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 YCL019WYCL019W 5313 nt3.41□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 TSC11YER093C 4293 nt3.41□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 YDL041WYDL041W 354 nt3.41□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 DLS1YJL065C 504 nt3.41□□□□□ -1.86
RKM4Q12504 YBL065WYBL065W 345 nt3.41□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.2 ms