Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 RSE1YML049C 4086 nt2.5□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 TOR1YJR066W 7413 nt2.49□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 YDR209CYDR209C 414 nt2.49□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 COX13YGL191W 390 nt2.49□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 RPI1YIL119C 1224 nt2.49□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 TIM8YJR135W-A 264 nt2.49□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 YLR458WYLR458W 381 nt2.49□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 DGK1YOR311C 873 nt2.49□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 SPC29YPL124W 762 nt2.49□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 YER138CYER138C 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 YER160CYER160C 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 YJR027WYJR027W 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 YML039WYML039W 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 YML045WYML045W 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 YMR050CYMR050C 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.49□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.49□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 YKU80YMR106C 1890 nt2.49□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 HAA1YPR008W 2085 nt2.49□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 FAR11YNL127W 2862 nt2.49□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt2.49□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 KEL2YGR238C 2649 nt2.49□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 ESC1YMR219W 4977 nt2.49□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 PTP3YER075C 2787 nt2.49□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt2.48□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 YCR001WYCR001W 315 nt2.48□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 RVS161YCR009C 798 nt2.48□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 BIG1YHR101C 1008 nt2.48□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 YKL111CYKL111C 336 nt2.48□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 YMR320WYMR320W 306 nt2.48□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 ATP15YPL271W 189 nt2.48□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 PDR1YGL013C 3207 nt2.48□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 INP53YOR109W 3324 nt2.48□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 EDS1YBR033W 2760 nt2.48□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 UBP11YKR098C 2154 nt2.47□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.47□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 CCW14YLR390W-A 717 nt2.47□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 YPL276WYPL276W 438 nt2.47□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 YBR277CYBR277C 402 nt2.47□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 RGA2YDR379W 3030 nt2.47□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 YPK1YKL126W 2043 nt2.47□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 SRO77YBL106C 3033 nt2.47□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 GIS1YDR096W 2685 nt2.46□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 SPE1YKL184W 1401 nt2.46□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 CAJ1YER048C 1176 nt2.46□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 YER084W-AYER084W-A 513 nt2.46□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 RPL40AYIL148W 387 nt2.46□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 YJR079WYJR079W 330 nt2.46□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 YLR171WYLR171W 390 nt2.46□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 SYM1YLR251W 594 nt2.46□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 ICY1YMR195W 384 nt2.46□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.46□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 FKS3YMR306W 5358 nt2.46□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 PTC5YOR090C 1719 nt2.45□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 ASM4YDL088C 1587 nt2.45□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 ISW1YBR245C 3390 nt2.45□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.45□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt2.45□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.45□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 TWF1YGR080W 999 nt2.45□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.45□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.45□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.45□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.45□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.45□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.45□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 YKL066WYKL066W 444 nt2.45□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 YLR031WYLR031W 561 nt2.45□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt2.45□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 MRD1YPR112C 2664 nt2.45□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 YDR186CYDR186C 2634 nt2.45□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 REV1YOR346W 2958 nt2.44□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 ORC2YBR060C 1863 nt2.44□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 SWR1YDR334W 4545 nt2.44□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 FMP16YDR070C 282 nt2.44□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 SDC1YDR469W 528 nt2.44□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 BI2Q0110 1272 nt2.44□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 YJL007CYJL007C 315 nt2.44□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 SHE2YKL130C 741 nt2.44□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 AIM32YML050W 936 nt2.44□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 SIP18YMR175W 240 nt2.44□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 YEL043WYEL043W 2871 nt2.43□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 NCL1YBL024W 2055 nt2.43□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 YDR239CYDR239C 2364 nt2.43□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 CBF2YGR140W 2871 nt2.43□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 YFR056CYFR056C 369 nt2.43□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt2.42□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt2.42□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt2.42□□□□□ -2.02
NMD4Q12129 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.42□□□□□ -2.02
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