Protein–RNA interactions for Protein: Q12016

VPS68, Vacuolar protein sorting-associated protein 68, yeastyeast

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS68Q12016 YGR228WYGR228W 345 nt1.7□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 CKA1YIL035C 1119 nt1.7□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 GMC2YLR445W 567 nt1.7□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 SWM2YNR004W 441 nt1.7□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 SNF12YNR023W 1701 nt1.7□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 ISW1YBR245C 3390 nt1.7□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 GPI17YDR434W 1605 nt1.69□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 YOR093CYOR093C 4947 nt1.69□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 SHE4YOR035C 2370 nt1.69□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 PRS3YHL011C 963 nt1.69□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 TAP42YMR028W 1101 nt1.69□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 COQ10YOL008W 624 nt1.69□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 YPL034WYPL034W 498 nt1.69□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 YPL039WYPL039W 951 nt1.69□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 CFT1YDR301W 4074 nt1.69□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 MYO2YOR326W 4725 nt1.68□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 TAF2YCR042C 4224 nt1.68□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 NUP192YJL039C 5052 nt1.68□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 YDR029WYDR029W 315 nt1.68□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 YDR199WYDR199W 366 nt1.68□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 RPS17BYDR447C 411 nt1.68□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 VMA21YGR105W 234 nt1.68□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 NOP19YGR251W 591 nt1.68□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt1.68□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 YLR302CYLR302C 363 nt1.68□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 OST2YOR103C 393 nt1.68□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 VID24YBR105C 1089 nt1.68□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 IRC20YLR247C 4671 nt1.68□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 AFR1YDR085C 1863 nt1.67□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 COS111YBR203W 2775 nt1.67□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 UBP16YPL072W 1500 nt1.67□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 YIL166CYIL166C 1629 nt1.67□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 snR76snR76 109 nt1.67□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 ADK1YDR226W 669 nt1.67□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 GLC7YER133W 939 nt1.67□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 YGL042CYGL042C 306 nt1.67□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 YGR050CYGR050C 357 nt1.67□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 DFG10YIL049W 762 nt1.67□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 PET191YJR034W 327 nt1.67□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 CSE4YKL049C 690 nt1.67□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 RPS29AYLR388W 171 nt1.67□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 ERG29YMR134W 714 nt1.67□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 TRM7YBR061C 933 nt1.67□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 ARR2YPR200C 393 nt1.67□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 LEU3YLR451W 2661 nt1.66□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 BAS1YKR099W 2436 nt1.66□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 IRC2YDR112W 309 nt1.66□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 YER189WYER189W 369 nt1.66□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 FYV4YHR059W 393 nt1.66□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 BUD19YJL188C 309 nt1.66□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt1.66□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 YKR051WYKR051W 1257 nt1.66□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 HRI1YLR301W 735 nt1.66□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 LSM2YBL026W 288 nt1.66□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 RGM1YMR182C 636 nt1.66□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 HHT2YNL031C 411 nt1.66□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 YNL046WYNL046W 519 nt1.66□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 YNL179CYNL179C 438 nt1.66□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt1.66□□□□□ -2.14
VPS68Q12016 NOP14YDL148C 2433 nt1.65□□□□□ -2.15
VPS68Q12016 YDL009CYDL009C 324 nt1.65□□□□□ -2.15
VPS68Q12016 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt1.65□□□□□ -2.15
VPS68Q12016 YMR320WYMR320W 306 nt1.65□□□□□ -2.15
VPS68Q12016 YNL034WYNL034W 1839 nt1.65□□□□□ -2.15
VPS68Q12016 ECM5YMR176W 4236 nt1.64□□□□□ -2.15
VPS68Q12016 HOS4YIL112W 3252 nt1.64□□□□□ -2.15
VPS68Q12016 DNF3YMR162C 4971 nt1.64□□□□□ -2.15
VPS68Q12016 YNL018CYNL018C 1839 nt1.64□□□□□ -2.15
VPS68Q12016 YDL187CYDL187C 330 nt1.64□□□□□ -2.15
VPS68Q12016 OCA6YDR067C 675 nt1.64□□□□□ -2.15
VPS68Q12016 TIM9YEL020W-A 264 nt1.64□□□□□ -2.15
VPS68Q12016 YER119C-AYER119C-A 372 nt1.64□□□□□ -2.15
VPS68Q12016 SCEIQ0160 708 nt1.64□□□□□ -2.15
VPS68Q12016 VPH2YKL119C 648 nt1.64□□□□□ -2.15
VPS68Q12016 RIO2YNL207W 1278 nt1.64□□□□□ -2.15
VPS68Q12016 NSL1YPL233W 651 nt1.64□□□□□ -2.15
VPS68Q12016 YPR153WYPR153W 423 nt1.64□□□□□ -2.15
VPS68Q12016 POM152YMR129W 4014 nt1.63□□□□□ -2.15
VPS68Q12016 HER1YOR227W 3741 nt1.63□□□□□ -2.15
VPS68Q12016 MYO4YAL029C 4416 nt1.63□□□□□ -2.15
VPS68Q12016 IRC10YOL015W 1761 nt1.63□□□□□ -2.15
VPS68Q12016 RAD6YGL058W 519 nt1.63□□□□□ -2.15
VPS68Q12016 EMC4YGL231C 573 nt1.63□□□□□ -2.15
VPS68Q12016 COG2YGR120C 789 nt1.63□□□□□ -2.15
VPS68Q12016 LRP1YHR081W 555 nt1.63□□□□□ -2.15
VPS68Q12016 YPR172WYPR172W 603 nt1.63□□□□□ -2.15
VPS68Q12016 UBR1YGR184C 5853 nt1.63□□□□□ -2.15
VPS68Q12016 RTP1YMR185W 2946 nt1.63□□□□□ -2.15
VPS68Q12016 RBK1YCR036W 1002 nt1.62□□□□□ -2.15
VPS68Q12016 YCR108CYCR108C 192 nt1.62□□□□□ -2.15
VPS68Q12016 GPI19YDR437W 423 nt1.62□□□□□ -2.15
VPS68Q12016 YGL165CYGL165C 579 nt1.62□□□□□ -2.15
VPS68Q12016 YHL037CYHL037C 402 nt1.62□□□□□ -2.15
VPS68Q12016 YIL029CYIL029C 429 nt1.62□□□□□ -2.15
VPS68Q12016 YLR271WYLR271W 825 nt1.62□□□□□ -2.15
VPS68Q12016 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt1.62□□□□□ -2.15
VPS68Q12016 COA6YMR244C-A 315 nt1.62□□□□□ -2.15
VPS68Q12016 SWS2YNL081C 432 nt1.62□□□□□ -2.15
VPS68Q12016 YOR364WYOR364W 369 nt1.62□□□□□ -2.15
VPS68Q12016 YPR096CYPR096C 303 nt1.62□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.9 ms