Protein–RNA interactions for Protein: Q06132

SGD1, Suppressor of glycerol defect protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 899 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGD1Q06132 PAM16YJL104W 450 nt3.6□□□□□ -1.83
SGD1Q06132 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt3.6□□□□□ -1.83
SGD1Q06132 RED1YLR263W 2484 nt3.6□□□□□ -1.83
SGD1Q06132 YKL222CYKL222C 2118 nt3.59□□□□□ -1.83
SGD1Q06132 YKL100CYKL100C 1764 nt3.59□□□□□ -1.83
SGD1Q06132 PEX5YDR244W 1839 nt3.59□□□□□ -1.83
SGD1Q06132 APQ12YIL040W 417 nt3.59□□□□□ -1.83
SGD1Q06132 RPS7AYOR096W 573 nt3.59□□□□□ -1.83
SGD1Q06132 YBR259WYBR259W 2067 nt3.59□□□□□ -1.83
SGD1Q06132 VBA4YDR119W 2307 nt3.59□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 YHR080CYHR080C 4038 nt3.59□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 UBP5YER144C 2418 nt3.59□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 ERG28YER044C 447 nt3.58□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 RPS26BYER131W 360 nt3.58□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 RPC10YHR143W-A 213 nt3.58□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 PAU14YIL176C 363 nt3.58□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 PAU1YJL223C 363 nt3.58□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 YLR458WYLR458W 381 nt3.58□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 TVP18YMR071C 504 nt3.58□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 YOR170WYOR170W 306 nt3.58□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 SSP1YHR184W 1716 nt3.58□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 MPS1YDL028C 2295 nt3.57□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 YDL242WYDL242W 354 nt3.57□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 YDR061WYDR061W 1620 nt3.57□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 MSH4YFL003C 2637 nt3.57□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 YGL041CYGL041C 204 nt3.57□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt3.57□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 CCW14YLR390W-A 717 nt3.57□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 YPL142CYPL142C 318 nt3.57□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 YSW1YBR148W 1830 nt3.57□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 DNM1YLL001W 2274 nt3.56□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 NOP4YPL043W 2058 nt3.56□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 SNX41YDR425W 1878 nt3.56□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 REG1YDR028C 3045 nt3.56□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 STE14YDR410C 720 nt3.56□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 RPL29YFR032C-A 180 nt3.56□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 BAT1YHR208W 1182 nt3.56□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 RPB11YOL005C 363 nt3.56□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 KIN82YCR091W 2163 nt3.56□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 YSP2YDR326C 4317 nt3.56□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 SQS1YNL224C 2304 nt3.55□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 YLR001CYLR001C 2589 nt3.55□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt3.55□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 GPI14YJR013W 1212 nt3.55□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 NSP1YJL041W 2472 nt3.55□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 BUB1YGR188C 3066 nt3.55□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 SNF12YNR023W 1701 nt3.55□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 YMR317WYMR317W 3423 nt3.54□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 CSR2YPR030W 3366 nt3.54□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 POL3YDL102W 3294 nt3.54□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 MET10YFR030W 3108 nt3.54□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 BCH1YMR237W 2175 nt3.54□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 CHS3YBR023C 3498 nt3.54□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 YER188C-AYER188C-A 300 nt3.54□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 YGL149WYGL149W 306 nt3.54□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 URM1YIL008W 300 nt3.54□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 PSY1YKL076C 384 nt3.54□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 TMA10YLR327C 261 nt3.54□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 ABF2YMR072W 552 nt3.54□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 EGD1YPL037C 474 nt3.54□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 HBT1YDL223C 3141 nt3.54□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 YTA7YGR270W 4140 nt3.54□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 NTO1YPR031W 2247 nt3.54□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 CHS2YBR038W 2892 nt3.53□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 IRC4YDR540C 540 nt3.53□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 RAD6YGL058W 519 nt3.53□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 YNL205CYNL205C 423 nt3.53□□□□□ -1.84
SGD1Q06132 MSH2YOL090W 2895 nt3.53□□□□□ -1.85
SGD1Q06132 MYO5YMR109W 3660 nt3.52□□□□□ -1.85
SGD1Q06132 HFM1YGL251C 3564 nt3.52□□□□□ -1.85
SGD1Q06132 YDL211CYDL211C 1119 nt3.52□□□□□ -1.85
SGD1Q06132 YDR344CYDR344C 444 nt3.52□□□□□ -1.85
SGD1Q06132 WIP1YDR374W-A 270 nt3.52□□□□□ -1.85
SGD1Q06132 YJR023CYJR023C 402 nt3.52□□□□□ -1.85
SGD1Q06132 YKL111CYKL111C 336 nt3.52□□□□□ -1.85
SGD1Q06132 PAU23YLR037C 375 nt3.52□□□□□ -1.85
SGD1Q06132 RPL37AYLR185W 267 nt3.52□□□□□ -1.85
SGD1Q06132 YNL338WYNL338W 159 nt3.52□□□□□ -1.85
SGD1Q06132 RSM19YNR037C 276 nt3.52□□□□□ -1.85
SGD1Q06132 VHR2YER064C 1518 nt3.52□□□□□ -1.85
SGD1Q06132 DBP10YDL031W 2988 nt3.52□□□□□ -1.85
SGD1Q06132 ARP7YPR034W 1434 nt3.52□□□□□ -1.85
SGD1Q06132 CBP2YHL038C 1893 nt3.52□□□□□ -1.85
SGD1Q06132 SRB4YER022W 2064 nt3.51□□□□□ -1.85
SGD1Q06132 RKM1YPL208W 1752 nt3.51□□□□□ -1.85
SGD1Q06132 TIF35YDR429C 825 nt3.51□□□□□ -1.85
SGD1Q06132 MDV1YJL112W 2145 nt3.51□□□□□ -1.85
SGD1Q06132 RPA34YJL148W 702 nt3.51□□□□□ -1.85
SGD1Q06132 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt3.51□□□□□ -1.85
SGD1Q06132 YNL170WYNL170W 396 nt3.51□□□□□ -1.85
SGD1Q06132 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt3.51□□□□□ -1.85
SGD1Q06132 snR49snR49 165 nt3.51□□□□□ -1.85
SGD1Q06132 FUN30YAL019W 3396 nt3.51□□□□□ -1.85
SGD1Q06132 TOM70YNL121C 1854 nt3.51□□□□□ -1.85
SGD1Q06132 MDM32YOR147W 1869 nt3.51□□□□□ -1.85
SGD1Q06132 DPB11YJL090C 2295 nt3.51□□□□□ -1.85
SGD1Q06132 PFK26YIL107C 2484 nt3.5□□□□□ -1.85
SGD1Q06132 MUS81YDR386W 1899 nt3.5□□□□□ -1.85
SGD1Q06132 SDH2YLL041C 801 nt3.5□□□□□ -1.85
SGD1Q06132 RPL26AYLR344W 384 nt3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 69.7 ms