Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms