Protein–RNA interactions for Protein: P41808

SMK1, Sporulation-specific mitogen-activated protein kinase SMK1, yeastyeast

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMK1P41808 SMA2YML066C 1110 nt2.67□□□□□ -1.98
SMK1P41808 YPK1YKL126W 2043 nt2.67□□□□□ -1.98
SMK1P41808 INP53YOR109W 3324 nt2.67□□□□□ -1.98
SMK1P41808 RAX2YLR084C 3663 nt2.67□□□□□ -1.98
SMK1P41808 CAF120YNL278W 3183 nt2.67□□□□□ -1.98
SMK1P41808 RNH70YGR276C 1662 nt2.66□□□□□ -1.98
SMK1P41808 GDS1YOR355W 1569 nt2.66□□□□□ -1.98
SMK1P41808 PMR1YGL167C 2853 nt2.66□□□□□ -1.98
SMK1P41808 CAJ1YER048C 1176 nt2.66□□□□□ -1.98
SMK1P41808 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt2.66□□□□□ -1.98
SMK1P41808 YKL111CYKL111C 336 nt2.66□□□□□ -1.98
SMK1P41808 CCW14YLR390W-A 717 nt2.66□□□□□ -1.98
SMK1P41808 PPN1YDR452W 2025 nt2.66□□□□□ -1.98
SMK1P41808 ILS1YBL076C 3219 nt2.66□□□□□ -1.98
SMK1P41808 HOS4YIL112W 3252 nt2.66□□□□□ -1.98
SMK1P41808 MRD1YPR112C 2664 nt2.65□□□□□ -1.98
SMK1P41808 ISW1YBR245C 3390 nt2.65□□□□□ -1.98
SMK1P41808 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.65□□□□□ -1.99
SMK1P41808 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.65□□□□□ -1.99
SMK1P41808 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.65□□□□□ -1.99
SMK1P41808 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.65□□□□□ -1.99
SMK1P41808 RPL23BYER117W 414 nt2.65□□□□□ -1.99
SMK1P41808 RPC10YHR143W-A 213 nt2.65□□□□□ -1.99
SMK1P41808 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt2.65□□□□□ -1.99
SMK1P41808 IGO1YNL157W 507 nt2.65□□□□□ -1.99
SMK1P41808 PRM3YPL192C 402 nt2.65□□□□□ -1.99
SMK1P41808 ATP15YPL271W 189 nt2.65□□□□□ -1.99
SMK1P41808 PRK1YIL095W 2433 nt2.65□□□□□ -1.99
SMK1P41808 TOP2YNL088W 4287 nt2.65□□□□□ -1.99
SMK1P41808 JSN1YJR091C 3276 nt2.65□□□□□ -1.99
SMK1P41808 VPS16YPL045W 2397 nt2.65□□□□□ -1.99
SMK1P41808 YDL068WYDL068W 330 nt2.64□□□□□ -1.99
SMK1P41808 SDC1YDR469W 528 nt2.64□□□□□ -1.99
SMK1P41808 HMF1YER057C 390 nt2.64□□□□□ -1.99
SMK1P41808 YFR056CYFR056C 369 nt2.64□□□□□ -1.99
SMK1P41808 TEN1YLR010C 483 nt2.64□□□□□ -1.99
SMK1P41808 HSC82YMR186W 2118 nt2.64□□□□□ -1.99
SMK1P41808 SNU114YKL173W 3027 nt2.64□□□□□ -1.99
SMK1P41808 DBP10YDL031W 2988 nt2.64□□□□□ -1.99
SMK1P41808 CBF2YGR140W 2871 nt2.63□□□□□ -1.99
SMK1P41808 NUP82YJL061W 2142 nt2.63□□□□□ -1.99
SMK1P41808 YJL181WYJL181W 1836 nt2.63□□□□□ -1.99
SMK1P41808 SLH1YGR271W 5904 nt2.63□□□□□ -1.99
SMK1P41808 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.63□□□□□ -1.99
SMK1P41808 NCE101YJL205C 162 nt2.63□□□□□ -1.99
SMK1P41808 YLR101CYLR101C 396 nt2.63□□□□□ -1.99
SMK1P41808 RPS29AYLR388W 171 nt2.63□□□□□ -1.99
SMK1P41808 PEX17YNL214W 600 nt2.63□□□□□ -1.99
SMK1P41808 CAT5YOR125C 702 nt2.63□□□□□ -1.99
SMK1P41808 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.63□□□□□ -1.99
SMK1P41808 FAR11YNL127W 2862 nt2.63□□□□□ -1.99
SMK1P41808 MSB2YGR014W 3921 nt2.62□□□□□ -1.99
SMK1P41808 PTC5YOR090C 1719 nt2.62□□□□□ -1.99
SMK1P41808 MMS1YPR164W 4224 nt2.62□□□□□ -1.99
SMK1P41808 UBP11YKR098C 2154 nt2.62□□□□□ -1.99
SMK1P41808 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.62□□□□□ -1.99
SMK1P41808 YLR269CYLR269C 351 nt2.62□□□□□ -1.99
SMK1P41808 YEL043WYEL043W 2871 nt2.62□□□□□ -1.99
SMK1P41808 TOM1YDR457W 9807 nt2.61□□□□□ -1.99
SMK1P41808 YNL018CYNL018C 1839 nt2.61□□□□□ -1.99
SMK1P41808 TFC4YGR047C 3078 nt2.61□□□□□ -1.99
SMK1P41808 YJL016WYJL016W 1686 nt2.61□□□□□ -1.99
SMK1P41808 YDR114CYDR114C 303 nt2.61□□□□□ -1.99
SMK1P41808 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.61□□□□□ -1.99
SMK1P41808 YER006C-AYER006C-A 318 nt2.61□□□□□ -1.99
SMK1P41808 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt2.61□□□□□ -1.99
SMK1P41808 NBL1YHR199C-A 222 nt2.61□□□□□ -1.99
SMK1P41808 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt2.61□□□□□ -1.99
SMK1P41808 NFU1YKL040C 771 nt2.61□□□□□ -1.99
SMK1P41808 IRC19YLL033W 693 nt2.61□□□□□ -1.99
SMK1P41808 YAR068WYAR068W 486 nt2.61□□□□□ -1.99
SMK1P41808 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt2.61□□□□□ -1.99
SMK1P41808 FYV12YOR183W 390 nt2.61□□□□□ -1.99
SMK1P41808 RPL33AYPL143W 324 nt2.61□□□□□ -1.99
SMK1P41808 BPT1YLL015W 4680 nt2.61□□□□□ -1.99
SMK1P41808 NAN1YPL126W 2691 nt2.61□□□□□ -1.99
SMK1P41808 REV1YOR346W 2958 nt2.61□□□□□ -1.99
SMK1P41808 TRS130YMR218C 3309 nt2.6□□□□□ -1.99
SMK1P41808 MMS22YLR320W 4365 nt2.6□□□□□ -1.99
SMK1P41808 AGA2YGL032C 264 nt2.6□□□□□ -1.99
SMK1P41808 LSM7YNL147W 348 nt2.6□□□□□ -1.99
SMK1P41808 YPL276WYPL276W 438 nt2.6□□□□□ -1.99
SMK1P41808 YPR039WYPR039W 336 nt2.6□□□□□ -1.99
SMK1P41808 ROX1YPR065W 1107 nt2.6□□□□□ -1.99
SMK1P41808 UBP14YBR058C 2346 nt2.6□□□□□ -1.99
SMK1P41808 NUP120YKL057C 3114 nt2.6□□□□□ -1.99
SMK1P41808 RIF1YBR275C 5751 nt2.6□□□□□ -1.99
SMK1P41808 NCL1YBL024W 2055 nt2.59□□□□□ -1.99
SMK1P41808 YPL216WYPL216W 3309 nt2.59□□□□□ -1.99
SMK1P41808 SMY2YBR172C 2223 nt2.59□□□□□ -1.99
SMK1P41808 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.59□□□□□ -1.99
SMK1P41808 SHE2YKL130C 741 nt2.59□□□□□ -1.99
SMK1P41808 CMC2YBL059C-A 330 nt2.59□□□□□ -1.99
SMK1P41808 snR13snR13 124 nt2.59□□□□□ -1.99
SMK1P41808 YOR385WYOR385W 873 nt2.59□□□□□ -1.99
SMK1P41808 TSC3YBR058C-A 243 nt2.59□□□□□ -1.99
SMK1P41808 YBR277CYBR277C 402 nt2.59□□□□□ -1.99
SMK1P41808 MPH1YIR002C 2982 nt2.59□□□□□ -2
SMK1P41808 SWA2YDR320C 2007 nt2.59□□□□□ -2
SMK1P41808 MOT1YPL082C 5604 nt2.59□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.1 ms