Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NLRP13Q86W25 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms