Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC62Q6P9F0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.1 ms