Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms