Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ODF4Q2M2E3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF4Q2M2E3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms