Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
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HIF1AQ16665 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
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HIF1AQ16665 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
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