Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC33.68■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
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EEA1Q15075 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
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EEA1Q15075 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
EEA1Q15075 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
EEA1Q15075 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
EEA1Q15075 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
EEA1Q15075 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
EEA1Q15075 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
EEA1Q15075 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
EEA1Q15075 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
EEA1Q15075 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
EEA1Q15075 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
EEA1Q15075 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
EEA1Q15075 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
EEA1Q15075 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
EEA1Q15075 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
EEA1Q15075 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
EEA1Q15075 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
EEA1Q15075 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
EEA1Q15075 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
EEA1Q15075 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
EEA1Q15075 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
EEA1Q15075 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
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