Protein–RNA interactions for Protein: Q03785

VHS1, Serine/threonine-protein kinase VHS1, yeastyeast

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1Q03785 RGR1YLR071C 3249 nt2.29□□□□□ -2.04
VHS1Q03785 DNL4YOR005C 2835 nt2.29□□□□□ -2.04
VHS1Q03785 SRB4YER022W 2064 nt2.29□□□□□ -2.04
VHS1Q03785 JJJ2YJL162C 1752 nt2.28□□□□□ -2.04
VHS1Q03785 URB2YJR041C 3525 nt2.28□□□□□ -2.04
VHS1Q03785 ISW1YBR245C 3390 nt2.28□□□□□ -2.04
VHS1Q03785 YDR537CYDR537C 606 nt2.28□□□□□ -2.04
VHS1Q03785 CAJ1YER048C 1176 nt2.28□□□□□ -2.04
VHS1Q03785 YPL205CYPL205C 345 nt2.28□□□□□ -2.04
VHS1Q03785 RPB5YBR154C 648 nt2.28□□□□□ -2.04
VHS1Q03785 DAD3YBR233W-A 285 nt2.28□□□□□ -2.04
VHS1Q03785 YCL023CYCL023C 348 nt2.28□□□□□ -2.04
VHS1Q03785 UBP15YMR304W 3693 nt2.28□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 ASM4YDL088C 1587 nt2.27□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 VTC1YER072W 390 nt2.27□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 YER175W-AYER175W-A 165 nt2.27□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 Q0142Q0142 177 nt2.27□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 TIM10YHR005C-A 282 nt2.27□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 YJL086CYJL086C 369 nt2.27□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 BIT61YJL058C 1632 nt2.27□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 BOI1YBL085W 2943 nt2.27□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 GDI1YER136W 1356 nt2.26□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 IRC2YDR112W 309 nt2.26□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 CHZ1YER030W 462 nt2.26□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 YER084W-AYER084W-A 513 nt2.26□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 AAD16YFL057C 459 nt2.26□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 COX13YGL191W 390 nt2.26□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 YGR042WYGR042W 816 nt2.26□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 SPO13YHR014W 876 nt2.26□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.26□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 SYM1YLR251W 594 nt2.26□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 YLR252WYLR252W 306 nt2.26□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 YMR144WYMR144W 1029 nt2.26□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 NGL1YOL042W 1092 nt2.26□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 ATX2YOR079C 942 nt2.26□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 YOR169CYOR169C 465 nt2.26□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 ORC2YBR060C 1863 nt2.26□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 NUP170YBL079W 4509 nt2.25□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 SEC16YPL085W 6588 nt2.25□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 SSY1YDR160W 2559 nt2.25□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 APL5YPL195W 2799 nt2.25□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 YDR199WYDR199W 366 nt2.25□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 RPL9AYGL147C 576 nt2.25□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 YJL007CYJL007C 315 nt2.25□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 YKL044WYKL044W 321 nt2.25□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt2.25□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 COX8YLR395C 237 nt2.25□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt2.25□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt2.25□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 RPL16BYNL069C 597 nt2.25□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 YPR096CYPR096C 303 nt2.25□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt2.25□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 YJL181WYJL181W 1836 nt2.25□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 UBP16YPL072W 1500 nt2.25□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 TOF1YNL273W 3717 nt2.25□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 TOP2YNL088W 4287 nt2.25□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 YOL098CYOL098C 3114 nt2.25□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 PCK1YKR097W 1650 nt2.25□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 SCY1YGL083W 2415 nt2.25□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 TPS2YDR074W 2691 nt2.24□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 SNX41YDR425W 1878 nt2.24□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 BTT1YDR252W 450 nt2.24□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 MET32YDR253C 576 nt2.24□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 VPS74YDR372C 1038 nt2.24□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 YGL042CYGL042C 306 nt2.24□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 YIL012WYIL012W 342 nt2.24□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 VPS51YKR020W 495 nt2.24□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 GPI15YNL038W 690 nt2.24□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 ALG14YBR070C 714 nt2.24□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 YDR338CYDR338C 2088 nt2.24□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 PDS5YMR076C 3834 nt2.23□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 SPR3YGR059W 1539 nt2.23□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 TFB1YDR311W 1929 nt2.23□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 SAP190YKR028W 3102 nt2.23□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 snR56snR56 88 nt2.23□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt2.23□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 PEX4YGR133W 552 nt2.23□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 HEM4YOR278W 828 nt2.23□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 PRM3YPL192C 402 nt2.23□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 RSA1YPL193W 1146 nt2.23□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 YPR014CYPR014C 330 nt2.23□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 VMA9YCL005W-A 222 nt2.23□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 SSD1YDR293C 3753 nt2.23□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 SSQ1YLR369W 1974 nt2.23□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 YGR242WYGR242W 309 nt2.22□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 AIM36YMR157C 768 nt2.22□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 RIO2YNL207W 1278 nt2.22□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 TOA1YOR194C 861 nt2.22□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 VID24YBR105C 1089 nt2.22□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 GDS1YOR355W 1569 nt2.22□□□□□ -2.05
VHS1Q03785 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt2.21□□□□□ -2.06
VHS1Q03785 RRI2YOL117W 1938 nt2.21□□□□□ -2.06
VHS1Q03785 RPL16AYIL133C 600 nt2.21□□□□□ -2.06
VHS1Q03785 DDR48YMR173W 1293 nt2.21□□□□□ -2.06
VHS1Q03785 YBT1YLL048C 4986 nt2.21□□□□□ -2.06
VHS1Q03785 BNI1YNL271C 5862 nt2.2□□□□□ -2.06
VHS1Q03785 YDL009CYDL009C 324 nt2.2□□□□□ -2.06
VHS1Q03785 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.2□□□□□ -2.06
VHS1Q03785 YLR255CYLR255C 354 nt2.2□□□□□ -2.06
VHS1Q03785 SEN15YMR059W 387 nt2.2□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 81.1 ms