Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 YPL034WYPL034W 498 nt2.32□□□□□ -2.04
SEC28P40509 RAV1YJR033C 4074 nt2.32□□□□□ -2.04
SEC28P40509 TAE2YPL009C 3117 nt2.31□□□□□ -2.04
SEC28P40509 BNI1YNL271C 5862 nt2.31□□□□□ -2.04
SEC28P40509 INO80YGL150C 4470 nt2.31□□□□□ -2.04
SEC28P40509 IRC2YDR112W 309 nt2.31□□□□□ -2.04
SEC28P40509 GET1YGL020C 708 nt2.31□□□□□ -2.04
SEC28P40509 PAU14YIL176C 363 nt2.31□□□□□ -2.04
SEC28P40509 PAU1YJL223C 363 nt2.31□□□□□ -2.04
SEC28P40509 HHT2YNL031C 411 nt2.31□□□□□ -2.04
SEC28P40509 SWM2YNR004W 441 nt2.31□□□□□ -2.04
SEC28P40509 ARL3YPL051W 597 nt2.31□□□□□ -2.04
SEC28P40509 MED8YBR193C 672 nt2.31□□□□□ -2.04
SEC28P40509 CSF1YLR087C 8877 nt2.31□□□□□ -2.04
SEC28P40509 MSL5YLR116W 1431 nt2.31□□□□□ -2.04
SEC28P40509 SCP160YJL080C 3669 nt2.31□□□□□ -2.04
SEC28P40509 YJL070CYJL070C 2667 nt2.31□□□□□ -2.04
SEC28P40509 TUS1YLR425W 3924 nt2.31□□□□□ -2.04
SEC28P40509 YGL165CYGL165C 579 nt2.3□□□□□ -2.04
SEC28P40509 SRP21YKL122C 504 nt2.3□□□□□ -2.04
SEC28P40509 SAP190YKR028W 3102 nt2.3□□□□□ -2.04
SEC28P40509 RRP6YOR001W 2202 nt2.29□□□□□ -2.04
SEC28P40509 CLN3YAL040C 1743 nt2.29□□□□□ -2.04
SEC28P40509 SSF1YHR066W 1362 nt2.29□□□□□ -2.04
SEC28P40509 YDL163WYDL163W 303 nt2.29□□□□□ -2.04
SEC28P40509 FMP16YDR070C 282 nt2.29□□□□□ -2.04
SEC28P40509 YDR199WYDR199W 366 nt2.29□□□□□ -2.04
SEC28P40509 YGL042CYGL042C 306 nt2.29□□□□□ -2.04
SEC28P40509 MND1YGL183C 660 nt2.29□□□□□ -2.04
SEC28P40509 PEX4YGR133W 552 nt2.29□□□□□ -2.04
SEC28P40509 PRS3YHL011C 963 nt2.29□□□□□ -2.04
SEC28P40509 URA5YML106W 681 nt2.29□□□□□ -2.04
SEC28P40509 YNL150WYNL150W 408 nt2.29□□□□□ -2.04
SEC28P40509 YBR063CYBR063C 1215 nt2.29□□□□□ -2.04
SEC28P40509 DAD3YBR233W-A 285 nt2.29□□□□□ -2.04
SEC28P40509 SSF2YDR312W 1362 nt2.28□□□□□ -2.04
SEC28P40509 YDR537CYDR537C 606 nt2.28□□□□□ -2.04
SEC28P40509 YGR018CYGR018C 330 nt2.28□□□□□ -2.04
SEC28P40509 YJR023CYJR023C 402 nt2.28□□□□□ -2.04
SEC28P40509 SHE2YKL130C 741 nt2.28□□□□□ -2.04
SEC28P40509 TAP42YMR028W 1101 nt2.28□□□□□ -2.04
SEC28P40509 YJL181WYJL181W 1836 nt2.28□□□□□ -2.04
SEC28P40509 UBP11YKR098C 2154 nt2.27□□□□□ -2.05
SEC28P40509 YPP1YGR198W 2454 nt2.27□□□□□ -2.05
SEC28P40509 YDL009CYDL009C 324 nt2.27□□□□□ -2.05
SEC28P40509 RPL29YFR032C-A 180 nt2.27□□□□□ -2.05
SEC28P40509 RAM2YKL019W 951 nt2.27□□□□□ -2.05
SEC28P40509 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.27□□□□□ -2.05
SEC28P40509 TAZ1YPR140W 1146 nt2.27□□□□□ -2.05
SEC28P40509 MET18YIL128W 3099 nt2.27□□□□□ -2.05
SEC28P40509 VTC3YPL019C 2508 nt2.27□□□□□ -2.05
SEC28P40509 IST2YBR086C 2841 nt2.27□□□□□ -2.05
SEC28P40509 RRP12YPL012W 3687 nt2.27□□□□□ -2.05
SEC28P40509 SIR4YDR227W 4077 nt2.27□□□□□ -2.05
SEC28P40509 PTC5YOR090C 1719 nt2.26□□□□□ -2.05
SEC28P40509 STD1YOR047C 1335 nt2.26□□□□□ -2.05
SEC28P40509 NDD1YOR372C 1665 nt2.26□□□□□ -2.05
SEC28P40509 APL5YPL195W 2799 nt2.26□□□□□ -2.05
SEC28P40509 YHR054CYHR054C 1065 nt2.26□□□□□ -2.05
SEC28P40509 HYR1YIR037W 492 nt2.26□□□□□ -2.05
SEC28P40509 HRI1YLR301W 735 nt2.26□□□□□ -2.05
SEC28P40509 YLR302CYLR302C 363 nt2.26□□□□□ -2.05
SEC28P40509 YLR379WYLR379W 375 nt2.26□□□□□ -2.05
SEC28P40509 GIM3YNL153C 390 nt2.26□□□□□ -2.05
SEC28P40509 ATX2YOR079C 942 nt2.26□□□□□ -2.05
SEC28P40509 YOR364WYOR364W 369 nt2.26□□□□□ -2.05
SEC28P40509 snR5snR5 204 nt2.25□□□□□ -2.05
SEC28P40509 YDL032WYDL032W 312 nt2.25□□□□□ -2.05
SEC28P40509 NCB2YDR397C 441 nt2.25□□□□□ -2.05
SEC28P40509 RAD6YGL058W 519 nt2.25□□□□□ -2.05
SEC28P40509 YIL058WYIL058W 285 nt2.25□□□□□ -2.05
SEC28P40509 IST3YIR005W 447 nt2.25□□□□□ -2.05
SEC28P40509 YJL147CYJL147C 1149 nt2.25□□□□□ -2.05
SEC28P40509 ERG29YMR134W 714 nt2.25□□□□□ -2.05
SEC28P40509 YNL050CYNL050C 813 nt2.25□□□□□ -2.05
SEC28P40509 PEX17YNL214W 600 nt2.25□□□□□ -2.05
SEC28P40509 REV1YOR346W 2958 nt2.25□□□□□ -2.05
SEC28P40509 GIP3YPL137C 3831 nt2.25□□□□□ -2.05
SEC28P40509 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt2.24□□□□□ -2.05
SEC28P40509 GPM2YDL021W 936 nt2.24□□□□□ -2.05
SEC28P40509 YGR226CYGR226C 210 nt2.24□□□□□ -2.05
SEC28P40509 YAP5YIR018W 738 nt2.24□□□□□ -2.05
SEC28P40509 YJL119CYJL119C 324 nt2.24□□□□□ -2.05
SEC28P40509 ECM9YKR004C 1134 nt2.24□□□□□ -2.05
SEC28P40509 ATG38YLR211C 681 nt2.24□□□□□ -2.05
SEC28P40509 NBP1YLR457C 960 nt2.24□□□□□ -2.05
SEC28P40509 LSM2YBL026W 288 nt2.24□□□□□ -2.05
SEC28P40509 MGR1YCL044C 1254 nt2.24□□□□□ -2.05
SEC28P40509 RGA1YOR127W 3024 nt2.23□□□□□ -2.05
SEC28P40509 UFD4YKL010C 4452 nt2.23□□□□□ -2.05
SEC28P40509 GAL80YML051W 1308 nt2.23□□□□□ -2.05
SEC28P40509 YFR016CYFR016C 3702 nt2.23□□□□□ -2.05
SEC28P40509 STH1YIL126W 4080 nt2.23□□□□□ -2.05
SEC28P40509 AHC2YCR082W 387 nt2.23□□□□□ -2.05
SEC28P40509 LAG1YHL003C 1236 nt2.23□□□□□ -2.05
SEC28P40509 DFG10YIL049W 762 nt2.23□□□□□ -2.05
SEC28P40509 YLR458WYLR458W 381 nt2.23□□□□□ -2.05
SEC28P40509 ATP18YML081C-A 180 nt2.23□□□□□ -2.05
SEC28P40509 TFC3YAL001C 3483 nt2.23□□□□□ -2.05
SEC28P40509 SNX41YDR425W 1878 nt2.22□□□□□ -2.05
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