Protein–RNA interactions for Protein: P39548

YAR028W, DUP240 protein YAR028W, yeastyeast

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YAR028WP39548 ABF2YMR072W 552 nt3.59□□□□□ -1.83
YAR028WP39548 snR49snR49 165 nt3.59□□□□□ -1.83
YAR028WP39548 GSC2YGR032W 5688 nt3.59□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 MCM7YBR202W 2538 nt3.59□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 TOM70YNL121C 1854 nt3.58□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 HTL1YCR020W-B 237 nt3.58□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 MZM1YDR493W 372 nt3.58□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 YGL041CYGL041C 204 nt3.58□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 ALG13YGL047W 609 nt3.58□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 DAD3YBR233W-A 285 nt3.58□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 SSY1YDR160W 2559 nt3.58□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 NAN1YPL126W 2691 nt3.58□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 LOS1YKL205W 3303 nt3.58□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 APE2YKL157W 2859 nt3.57□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 RPL14BYHL001W 417 nt3.57□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 SDH2YLL041C 801 nt3.57□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 USA1YML029W 2517 nt3.57□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 YNR042WYNR042W 429 nt3.57□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 SGO1YOR073W 1773 nt3.57□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 HFM1YGL251C 3564 nt3.57□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 ABP140YOR239W 1887 nt3.56□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 MCD1YDL003W 1701 nt3.56□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 RAD26YJR035W 3258 nt3.56□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt3.56□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 GPI14YJR013W 1212 nt3.56□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 RPS23BYPR132W 438 nt3.56□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 snR42snR42 351 nt3.56□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 ATP25YMR098C 1839 nt3.56□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 RPO21YDL140C 5202 nt3.56□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 CDH1YGL003C 1701 nt3.56□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 YJL016WYJL016W 1686 nt3.55□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 SPT16YGL207W 3108 nt3.55□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt3.55□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 YGR151CYGR151C 336 nt3.55□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 NCE101YJL205C 162 nt3.55□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 PEX11YOL147C 711 nt3.55□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt3.55□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 NMA111YNL123W 2994 nt3.55□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 YPR003CYPR003C 2265 nt3.55□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 GYL1YMR192W 2163 nt3.55□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 VPS41YDR080W 2979 nt3.54□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 OSH3YHR073W 2991 nt3.54□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 GPI10YGL142C 1851 nt3.54□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 RRN6YBL014C 2685 nt3.54□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt3.54□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 YDL062WYDL062W 426 nt3.54□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 CSN9YDR179C 489 nt3.54□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 YGR051CYGR051C 324 nt3.54□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt3.54□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 MGR1YCL044C 1254 nt3.54□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 VPS52YDR484W 1926 nt3.54□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 NOG1YPL093W 1944 nt3.54□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 CCM1YGR150C 2595 nt3.54□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 NUP159YIL115C 4383 nt3.54□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 IOC3YFR013W 2364 nt3.53□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 YFH1YDL120W 525 nt3.53□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 RPS24AYER074W 408 nt3.53□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt3.53□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt3.53□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt3.53□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 YPR014CYPR014C 330 nt3.53□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 YGL140CYGL140C 3660 nt3.53□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 PHO81YGR233C 3537 nt3.53□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 TOP1YOL006C 2310 nt3.53□□□□□ -1.84
YAR028WP39548 YCG1YDR325W 3108 nt3.52□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 YDL041WYDL041W 354 nt3.52□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 YIL058WYIL058W 285 nt3.52□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt3.52□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 FLO10YKR102W 3510 nt3.52□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 NUP82YJL061W 2142 nt3.52□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 CHS3YBR023C 3498 nt3.51□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 HCS1YKL017C 2052 nt3.51□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 REV1YOR346W 2958 nt3.51□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 CWH43YCR017C 2862 nt3.51□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 TMA17YDL110C 453 nt3.51□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 YJR112W-AYJR112W-A 330 nt3.51□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 YPL182CYPL182C 384 nt3.51□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 ATP15YPL271W 189 nt3.51□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 BNI4YNL233W 2679 nt3.51□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 YNL034WYNL034W 1839 nt3.51□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 YRM1YOR172W 2361 nt3.51□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 CDC45YLR103C 1953 nt3.51□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 KRE5YOR336W 4098 nt3.5□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 EMC1YCL045C 2283 nt3.5□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 HSK3YKL138C-A 210 nt3.5□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 YNL057WYNL057W 333 nt3.5□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 RPS7AYOR096W 573 nt3.5□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 snR191snR191 274 nt3.5□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 SWD3YBR175W 948 nt3.5□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 YLL032CYLL032C 2478 nt3.5□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 FRT2YAL028W 1587 nt3.5□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 PWP2YCR057C 2772 nt3.5□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 BIT61YJL058C 1632 nt3.49□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 ARO80YDR421W 2853 nt3.49□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt3.49□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 RPA34YJL148W 702 nt3.49□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 YKR033CYKR033C 426 nt3.49□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 RPS18BYML026C 441 nt3.49□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt3.49□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 IES4YOR189W 351 nt3.49□□□□□ -1.85
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