Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms