Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO3A2RU48 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms