Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms