Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRIP3Q6Q6R5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRIP3Q6Q6R5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms