Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC62Q6P9F0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.9 ms