Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q3C1V9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3C1V9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3C1V9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3C1V9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3C1V9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3C1V9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3C1V9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3C1V9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3C1V9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3C1V9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3C1V9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3C1V9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3C1V9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3C1V9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3C1V9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3C1V9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3C1V9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3C1V9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3C1V9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3C1V9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3C1V9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3C1V9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3C1V9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3C1V9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3C1V9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3C1V9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3C1V9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3C1V9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3C1V9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3C1V9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3C1V9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3C1V9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3C1V9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3C1V9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3C1V9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3C1V9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3C1V9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3C1V9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3C1V9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3C1V9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3C1V9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3C1V9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3C1V9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3C1V9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3C1V9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3C1V9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3C1V9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3C1V9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3C1V9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3C1V9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3C1V9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3C1V9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3C1V9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3C1V9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3C1V9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3C1V9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3C1V9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3C1V9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3C1V9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3C1V9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3C1V9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3C1V9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3C1V9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3C1V9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3C1V9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3C1V9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3C1V9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3C1V9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3C1V9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3C1V9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3C1V9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3C1V9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3C1V9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3C1V9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q3C1V9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q3C1V9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Q3C1V9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q3C1V9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q3C1V9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3C1V9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3C1V9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3C1V9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3C1V9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3C1V9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3C1V9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3C1V9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3C1V9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3C1V9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3C1V9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3C1V9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3C1V9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3C1V9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3C1V9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3C1V9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3C1V9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3C1V9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3C1V9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3C1V9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q3C1V9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms