Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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